Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rdh11Q9QYF1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rdh11Q9QYF1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rdh11Q9QYF1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rdh11Q9QYF1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rdh11Q9QYF1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rdh11Q9QYF1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rdh11Q9QYF1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rdh11Q9QYF1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rdh11Q9QYF1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rdh11Q9QYF1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rdh11Q9QYF1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rdh11Q9QYF1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rdh11Q9QYF1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rdh11Q9QYF1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rdh11Q9QYF1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rdh11Q9QYF1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rdh11Q9QYF1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rdh11Q9QYF1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rdh11Q9QYF1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rdh11Q9QYF1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rdh11Q9QYF1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rdh11Q9QYF1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rdh11Q9QYF1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rdh11Q9QYF1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rdh11Q9QYF1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rdh11Q9QYF1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rdh11Q9QYF1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rdh11Q9QYF1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rdh11Q9QYF1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdh11Q9QYF1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdh11Q9QYF1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdh11Q9QYF1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdh11Q9QYF1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdh11Q9QYF1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rdh11Q9QYF1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rdh11Q9QYF1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rdh11Q9QYF1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rdh11Q9QYF1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rdh11Q9QYF1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rdh11Q9QYF1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rdh11Q9QYF1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rdh11Q9QYF1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rdh11Q9QYF1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rdh11Q9QYF1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms