Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Homer2Q9QWW1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Homer2Q9QWW1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Homer2Q9QWW1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Homer2Q9QWW1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Homer2Q9QWW1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Homer2Q9QWW1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Homer2Q9QWW1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Homer2Q9QWW1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Homer2Q9QWW1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Homer2Q9QWW1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Homer2Q9QWW1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Homer2Q9QWW1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Homer2Q9QWW1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Homer2Q9QWW1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Homer2Q9QWW1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Homer2Q9QWW1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Homer2Q9QWW1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Homer2Q9QWW1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Homer2Q9QWW1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Homer2Q9QWW1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Homer2Q9QWW1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Homer2Q9QWW1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Homer2Q9QWW1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Homer2Q9QWW1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Homer2Q9QWW1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Homer2Q9QWW1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Homer2Q9QWW1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Homer2Q9QWW1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Homer2Q9QWW1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Homer2Q9QWW1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Homer2Q9QWW1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Homer2Q9QWW1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Homer2Q9QWW1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Homer2Q9QWW1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Homer2Q9QWW1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Homer2Q9QWW1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Homer2Q9QWW1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Homer2Q9QWW1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Homer2Q9QWW1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Homer2Q9QWW1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Homer2Q9QWW1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Homer2Q9QWW1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Homer2Q9QWW1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Homer2Q9QWW1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Homer2Q9QWW1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Homer2Q9QWW1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Homer2Q9QWW1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Homer2Q9QWW1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Homer2Q9QWW1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Homer2Q9QWW1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Homer2Q9QWW1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Homer2Q9QWW1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Homer2Q9QWW1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Homer2Q9QWW1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Homer2Q9QWW1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Homer2Q9QWW1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Homer2Q9QWW1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Homer2Q9QWW1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Homer2Q9QWW1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Homer2Q9QWW1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Homer2Q9QWW1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Homer2Q9QWW1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Homer2Q9QWW1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Homer2Q9QWW1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Homer2Q9QWW1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Homer2Q9QWW1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Homer2Q9QWW1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Homer2Q9QWW1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Homer2Q9QWW1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Homer2Q9QWW1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Homer2Q9QWW1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Homer2Q9QWW1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Homer2Q9QWW1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Homer2Q9QWW1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Homer2Q9QWW1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Homer2Q9QWW1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Homer2Q9QWW1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Homer2Q9QWW1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Homer2Q9QWW1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Homer2Q9QWW1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Homer2Q9QWW1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Homer2Q9QWW1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Homer2Q9QWW1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Homer2Q9QWW1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Homer2Q9QWW1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Homer2Q9QWW1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Homer2Q9QWW1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Homer2Q9QWW1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Homer2Q9QWW1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Homer2Q9QWW1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Homer2Q9QWW1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Homer2Q9QWW1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Homer2Q9QWW1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Homer2Q9QWW1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Homer2Q9QWW1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Homer2Q9QWW1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Homer2Q9QWW1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Homer2Q9QWW1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Homer2Q9QWW1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms