Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUP5

Hapln1, Hyaluronan and proteoglycan link protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln1Q9QUP5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hapln1Q9QUP5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hapln1Q9QUP5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hapln1Q9QUP5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Hapln1Q9QUP5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hapln1Q9QUP5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hapln1Q9QUP5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hapln1Q9QUP5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hapln1Q9QUP5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hapln1Q9QUP5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hapln1Q9QUP5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hapln1Q9QUP5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hapln1Q9QUP5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hapln1Q9QUP5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hapln1Q9QUP5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hapln1Q9QUP5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hapln1Q9QUP5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hapln1Q9QUP5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Hapln1Q9QUP5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hapln1Q9QUP5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hapln1Q9QUP5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hapln1Q9QUP5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hapln1Q9QUP5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hapln1Q9QUP5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hapln1Q9QUP5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hapln1Q9QUP5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hapln1Q9QUP5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hapln1Q9QUP5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hapln1Q9QUP5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hapln1Q9QUP5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hapln1Q9QUP5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hapln1Q9QUP5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hapln1Q9QUP5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hapln1Q9QUP5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hapln1Q9QUP5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hapln1Q9QUP5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hapln1Q9QUP5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hapln1Q9QUP5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hapln1Q9QUP5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Hapln1Q9QUP5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hapln1Q9QUP5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hapln1Q9QUP5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hapln1Q9QUP5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hapln1Q9QUP5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Hapln1Q9QUP5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hapln1Q9QUP5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hapln1Q9QUP5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hapln1Q9QUP5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hapln1Q9QUP5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hapln1Q9QUP5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hapln1Q9QUP5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hapln1Q9QUP5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hapln1Q9QUP5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hapln1Q9QUP5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hapln1Q9QUP5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hapln1Q9QUP5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hapln1Q9QUP5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hapln1Q9QUP5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hapln1Q9QUP5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hapln1Q9QUP5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hapln1Q9QUP5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hapln1Q9QUP5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hapln1Q9QUP5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hapln1Q9QUP5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hapln1Q9QUP5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hapln1Q9QUP5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hapln1Q9QUP5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hapln1Q9QUP5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hapln1Q9QUP5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hapln1Q9QUP5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hapln1Q9QUP5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hapln1Q9QUP5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hapln1Q9QUP5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hapln1Q9QUP5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hapln1Q9QUP5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hapln1Q9QUP5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hapln1Q9QUP5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hapln1Q9QUP5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hapln1Q9QUP5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hapln1Q9QUP5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hapln1Q9QUP5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Hapln1Q9QUP5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Hapln1Q9QUP5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hapln1Q9QUP5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hapln1Q9QUP5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hapln1Q9QUP5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hapln1Q9QUP5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hapln1Q9QUP5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hapln1Q9QUP5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Hapln1Q9QUP5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hapln1Q9QUP5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hapln1Q9QUP5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hapln1Q9QUP5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hapln1Q9QUP5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hapln1Q9QUP5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Hapln1Q9QUP5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hapln1Q9QUP5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hapln1Q9QUP5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Hapln1Q9QUP5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hapln1Q9QUP5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms