Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr4Q9QUK6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr4Q9QUK6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tlr4Q9QUK6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tlr4Q9QUK6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tlr4Q9QUK6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tlr4Q9QUK6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tlr4Q9QUK6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tlr4Q9QUK6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tlr4Q9QUK6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tlr4Q9QUK6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tlr4Q9QUK6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tlr4Q9QUK6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tlr4Q9QUK6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tlr4Q9QUK6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tlr4Q9QUK6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tlr4Q9QUK6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tlr4Q9QUK6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tlr4Q9QUK6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr4Q9QUK6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr4Q9QUK6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tlr4Q9QUK6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tlr4Q9QUK6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tlr4Q9QUK6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tlr4Q9QUK6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlr4Q9QUK6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlr4Q9QUK6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlr4Q9QUK6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tlr4Q9QUK6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tlr4Q9QUK6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tlr4Q9QUK6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tlr4Q9QUK6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tlr4Q9QUK6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlr4Q9QUK6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlr4Q9QUK6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlr4Q9QUK6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlr4Q9QUK6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tlr4Q9QUK6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tlr4Q9QUK6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tlr4Q9QUK6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tlr4Q9QUK6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tlr4Q9QUK6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tlr4Q9QUK6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tlr4Q9QUK6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr4Q9QUK6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr4Q9QUK6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr4Q9QUK6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr4Q9QUK6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlr4Q9QUK6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlr4Q9QUK6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlr4Q9QUK6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlr4Q9QUK6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlr4Q9QUK6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tlr4Q9QUK6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tlr4Q9QUK6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlr4Q9QUK6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlr4Q9QUK6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlr4Q9QUK6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tlr4Q9QUK6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlr4Q9QUK6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlr4Q9QUK6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlr4Q9QUK6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlr4Q9QUK6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tlr4Q9QUK6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tlr4Q9QUK6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tlr4Q9QUK6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlr4Q9QUK6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlr4Q9QUK6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlr4Q9QUK6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlr4Q9QUK6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlr4Q9QUK6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlr4Q9QUK6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlr4Q9QUK6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlr4Q9QUK6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlr4Q9QUK6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tlr4Q9QUK6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tlr4Q9QUK6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tlr4Q9QUK6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tlr4Q9QUK6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tlr4Q9QUK6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tlr4Q9QUK6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr4Q9QUK6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr4Q9QUK6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr4Q9QUK6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr4Q9QUK6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr4Q9QUK6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr4Q9QUK6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr4Q9QUK6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr4Q9QUK6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr4Q9QUK6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr4Q9QUK6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlr4Q9QUK6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlr4Q9QUK6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlr4Q9QUK6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr4Q9QUK6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlr4Q9QUK6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlr4Q9QUK6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlr4Q9QUK6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlr4Q9QUK6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlr4Q9QUK6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms