Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tmod4Q9JLH8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmod4Q9JLH8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmod4Q9JLH8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmod4Q9JLH8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmod4Q9JLH8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Tmod4Q9JLH8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tmod4Q9JLH8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tmod4Q9JLH8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tmod4Q9JLH8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmod4Q9JLH8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmod4Q9JLH8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmod4Q9JLH8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmod4Q9JLH8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmod4Q9JLH8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmod4Q9JLH8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tmod4Q9JLH8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tmod4Q9JLH8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmod4Q9JLH8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmod4Q9JLH8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tmod4Q9JLH8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tmod4Q9JLH8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmod4Q9JLH8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmod4Q9JLH8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmod4Q9JLH8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmod4Q9JLH8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmod4Q9JLH8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmod4Q9JLH8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmod4Q9JLH8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmod4Q9JLH8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tmod4Q9JLH8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tmod4Q9JLH8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmod4Q9JLH8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmod4Q9JLH8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmod4Q9JLH8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmod4Q9JLH8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmod4Q9JLH8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmod4Q9JLH8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmod4Q9JLH8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmod4Q9JLH8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tmod4Q9JLH8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tmod4Q9JLH8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tmod4Q9JLH8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tmod4Q9JLH8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tmod4Q9JLH8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tmod4Q9JLH8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmod4Q9JLH8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmod4Q9JLH8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmod4Q9JLH8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmod4Q9JLH8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmod4Q9JLH8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmod4Q9JLH8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmod4Q9JLH8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmod4Q9JLH8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmod4Q9JLH8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tmod4Q9JLH8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tmod4Q9JLH8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tmod4Q9JLH8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tmod4Q9JLH8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmod4Q9JLH8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmod4Q9JLH8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmod4Q9JLH8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmod4Q9JLH8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmod4Q9JLH8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmod4Q9JLH8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmod4Q9JLH8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tmod4Q9JLH8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmod4Q9JLH8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmod4Q9JLH8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmod4Q9JLH8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmod4Q9JLH8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmod4Q9JLH8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmod4Q9JLH8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmod4Q9JLH8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmod4Q9JLH8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmod4Q9JLH8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmod4Q9JLH8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmod4Q9JLH8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmod4Q9JLH8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tmod4Q9JLH8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Tmod4Q9JLH8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tmod4Q9JLH8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tmod4Q9JLH8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmod4Q9JLH8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmod4Q9JLH8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmod4Q9JLH8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmod4Q9JLH8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmod4Q9JLH8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmod4Q9JLH8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmod4Q9JLH8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmod4Q9JLH8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmod4Q9JLH8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmod4Q9JLH8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmod4Q9JLH8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmod4Q9JLH8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmod4Q9JLH8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmod4Q9JLH8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tmod4Q9JLH8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Tmod4Q9JLH8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tmod4Q9JLH8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
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