Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hmgn5Q9JL35 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hmgn5Q9JL35 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hmgn5Q9JL35 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hmgn5Q9JL35 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hmgn5Q9JL35 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hmgn5Q9JL35 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hmgn5Q9JL35 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hmgn5Q9JL35 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hmgn5Q9JL35 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Hmgn5Q9JL35 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hmgn5Q9JL35 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hmgn5Q9JL35 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hmgn5Q9JL35 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hmgn5Q9JL35 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hmgn5Q9JL35 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hmgn5Q9JL35 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Hmgn5Q9JL35 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hmgn5Q9JL35 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hmgn5Q9JL35 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Hmgn5Q9JL35 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hmgn5Q9JL35 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hmgn5Q9JL35 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hmgn5Q9JL35 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hmgn5Q9JL35 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hmgn5Q9JL35 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hmgn5Q9JL35 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hmgn5Q9JL35 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hmgn5Q9JL35 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hmgn5Q9JL35 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Hmgn5Q9JL35 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hmgn5Q9JL35 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hmgn5Q9JL35 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hmgn5Q9JL35 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hmgn5Q9JL35 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hmgn5Q9JL35 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hmgn5Q9JL35 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hmgn5Q9JL35 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hmgn5Q9JL35 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hmgn5Q9JL35 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hmgn5Q9JL35 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hmgn5Q9JL35 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hmgn5Q9JL35 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hmgn5Q9JL35 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Hmgn5Q9JL35 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hmgn5Q9JL35 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hmgn5Q9JL35 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hmgn5Q9JL35 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hmgn5Q9JL35 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hmgn5Q9JL35 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hmgn5Q9JL35 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hmgn5Q9JL35 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hmgn5Q9JL35 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hmgn5Q9JL35 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hmgn5Q9JL35 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hmgn5Q9JL35 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hmgn5Q9JL35 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hmgn5Q9JL35 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Hmgn5Q9JL35 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Hmgn5Q9JL35 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hmgn5Q9JL35 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hmgn5Q9JL35 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hmgn5Q9JL35 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hmgn5Q9JL35 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hmgn5Q9JL35 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hmgn5Q9JL35 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hmgn5Q9JL35 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hmgn5Q9JL35 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hmgn5Q9JL35 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hmgn5Q9JL35 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hmgn5Q9JL35 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hmgn5Q9JL35 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hmgn5Q9JL35 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hmgn5Q9JL35 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hmgn5Q9JL35 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hmgn5Q9JL35 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hmgn5Q9JL35 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Hmgn5Q9JL35 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hmgn5Q9JL35 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hmgn5Q9JL35 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hmgn5Q9JL35 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hmgn5Q9JL35 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hmgn5Q9JL35 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hmgn5Q9JL35 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hmgn5Q9JL35 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hmgn5Q9JL35 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hmgn5Q9JL35 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hmgn5Q9JL35 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hmgn5Q9JL35 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hmgn5Q9JL35 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hmgn5Q9JL35 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hmgn5Q9JL35 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hmgn5Q9JL35 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hmgn5Q9JL35 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hmgn5Q9JL35 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hmgn5Q9JL35 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hmgn5Q9JL35 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Hmgn5Q9JL35 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hmgn5Q9JL35 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms