Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctnnbip1Q9JJN6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctnnbip1Q9JJN6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctnnbip1Q9JJN6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctnnbip1Q9JJN6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctnnbip1Q9JJN6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctnnbip1Q9JJN6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctnnbip1Q9JJN6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctnnbip1Q9JJN6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctnnbip1Q9JJN6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnbip1Q9JJN6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnnbip1Q9JJN6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnbip1Q9JJN6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnbip1Q9JJN6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnbip1Q9JJN6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnbip1Q9JJN6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnbip1Q9JJN6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnbip1Q9JJN6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnbip1Q9JJN6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnbip1Q9JJN6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnbip1Q9JJN6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnbip1Q9JJN6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnbip1Q9JJN6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnbip1Q9JJN6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnbip1Q9JJN6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnnbip1Q9JJN6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnbip1Q9JJN6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnbip1Q9JJN6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnbip1Q9JJN6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnbip1Q9JJN6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnbip1Q9JJN6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnbip1Q9JJN6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnbip1Q9JJN6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnbip1Q9JJN6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnbip1Q9JJN6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnbip1Q9JJN6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnbip1Q9JJN6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnbip1Q9JJN6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnbip1Q9JJN6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnbip1Q9JJN6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnbip1Q9JJN6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnbip1Q9JJN6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnbip1Q9JJN6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnbip1Q9JJN6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnbip1Q9JJN6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnbip1Q9JJN6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnbip1Q9JJN6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnbip1Q9JJN6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnbip1Q9JJN6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnbip1Q9JJN6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnnbip1Q9JJN6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnbip1Q9JJN6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnbip1Q9JJN6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnbip1Q9JJN6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnbip1Q9JJN6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnbip1Q9JJN6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnbip1Q9JJN6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnbip1Q9JJN6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnbip1Q9JJN6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnbip1Q9JJN6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnbip1Q9JJN6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnbip1Q9JJN6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnbip1Q9JJN6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnbip1Q9JJN6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnbip1Q9JJN6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnbip1Q9JJN6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnbip1Q9JJN6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnbip1Q9JJN6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms