Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN0

Polh, DNA polymerase eta, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolhQ9JJN0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PolhQ9JJN0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PolhQ9JJN0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PolhQ9JJN0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PolhQ9JJN0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PolhQ9JJN0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PolhQ9JJN0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PolhQ9JJN0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PolhQ9JJN0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PolhQ9JJN0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PolhQ9JJN0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PolhQ9JJN0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PolhQ9JJN0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PolhQ9JJN0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PolhQ9JJN0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PolhQ9JJN0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PolhQ9JJN0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PolhQ9JJN0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PolhQ9JJN0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PolhQ9JJN0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PolhQ9JJN0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PolhQ9JJN0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PolhQ9JJN0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PolhQ9JJN0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PolhQ9JJN0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PolhQ9JJN0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PolhQ9JJN0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PolhQ9JJN0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PolhQ9JJN0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PolhQ9JJN0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PolhQ9JJN0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PolhQ9JJN0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PolhQ9JJN0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PolhQ9JJN0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PolhQ9JJN0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PolhQ9JJN0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PolhQ9JJN0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PolhQ9JJN0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PolhQ9JJN0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PolhQ9JJN0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PolhQ9JJN0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PolhQ9JJN0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PolhQ9JJN0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PolhQ9JJN0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PolhQ9JJN0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PolhQ9JJN0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PolhQ9JJN0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PolhQ9JJN0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PolhQ9JJN0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PolhQ9JJN0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PolhQ9JJN0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PolhQ9JJN0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PolhQ9JJN0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PolhQ9JJN0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PolhQ9JJN0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PolhQ9JJN0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PolhQ9JJN0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PolhQ9JJN0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PolhQ9JJN0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PolhQ9JJN0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PolhQ9JJN0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PolhQ9JJN0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PolhQ9JJN0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PolhQ9JJN0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PolhQ9JJN0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PolhQ9JJN0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PolhQ9JJN0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PolhQ9JJN0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PolhQ9JJN0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PolhQ9JJN0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PolhQ9JJN0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PolhQ9JJN0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PolhQ9JJN0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PolhQ9JJN0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PolhQ9JJN0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PolhQ9JJN0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PolhQ9JJN0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PolhQ9JJN0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PolhQ9JJN0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PolhQ9JJN0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PolhQ9JJN0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PolhQ9JJN0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PolhQ9JJN0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PolhQ9JJN0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PolhQ9JJN0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PolhQ9JJN0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PolhQ9JJN0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PolhQ9JJN0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PolhQ9JJN0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PolhQ9JJN0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PolhQ9JJN0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PolhQ9JJN0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PolhQ9JJN0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PolhQ9JJN0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PolhQ9JJN0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PolhQ9JJN0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PolhQ9JJN0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PolhQ9JJN0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PolhQ9JJN0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PolhQ9JJN0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms