Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ72

Rprm, Protein reprimo, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RprmQ9JJ72 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RprmQ9JJ72 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RprmQ9JJ72 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RprmQ9JJ72 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RprmQ9JJ72 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RprmQ9JJ72 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RprmQ9JJ72 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RprmQ9JJ72 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RprmQ9JJ72 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RprmQ9JJ72 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RprmQ9JJ72 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RprmQ9JJ72 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RprmQ9JJ72 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RprmQ9JJ72 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RprmQ9JJ72 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RprmQ9JJ72 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RprmQ9JJ72 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RprmQ9JJ72 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RprmQ9JJ72 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RprmQ9JJ72 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RprmQ9JJ72 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RprmQ9JJ72 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RprmQ9JJ72 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RprmQ9JJ72 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RprmQ9JJ72 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RprmQ9JJ72 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RprmQ9JJ72 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RprmQ9JJ72 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RprmQ9JJ72 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RprmQ9JJ72 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RprmQ9JJ72 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RprmQ9JJ72 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RprmQ9JJ72 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RprmQ9JJ72 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RprmQ9JJ72 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RprmQ9JJ72 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RprmQ9JJ72 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RprmQ9JJ72 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RprmQ9JJ72 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RprmQ9JJ72 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RprmQ9JJ72 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RprmQ9JJ72 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RprmQ9JJ72 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RprmQ9JJ72 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RprmQ9JJ72 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RprmQ9JJ72 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RprmQ9JJ72 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RprmQ9JJ72 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RprmQ9JJ72 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RprmQ9JJ72 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RprmQ9JJ72 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RprmQ9JJ72 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RprmQ9JJ72 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RprmQ9JJ72 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RprmQ9JJ72 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RprmQ9JJ72 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RprmQ9JJ72 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RprmQ9JJ72 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RprmQ9JJ72 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RprmQ9JJ72 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RprmQ9JJ72 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
RprmQ9JJ72 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RprmQ9JJ72 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RprmQ9JJ72 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RprmQ9JJ72 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RprmQ9JJ72 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RprmQ9JJ72 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RprmQ9JJ72 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RprmQ9JJ72 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RprmQ9JJ72 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RprmQ9JJ72 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RprmQ9JJ72 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms