Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cacna1fQ9JIS7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Cacna1fQ9JIS7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cacna1fQ9JIS7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cacna1fQ9JIS7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cacna1fQ9JIS7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cacna1fQ9JIS7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cacna1fQ9JIS7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cacna1fQ9JIS7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cacna1fQ9JIS7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cacna1fQ9JIS7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cacna1fQ9JIS7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cacna1fQ9JIS7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cacna1fQ9JIS7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cacna1fQ9JIS7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cacna1fQ9JIS7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cacna1fQ9JIS7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cacna1fQ9JIS7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cacna1fQ9JIS7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cacna1fQ9JIS7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cacna1fQ9JIS7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cacna1fQ9JIS7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cacna1fQ9JIS7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Cacna1fQ9JIS7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cacna1fQ9JIS7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cacna1fQ9JIS7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cacna1fQ9JIS7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cacna1fQ9JIS7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cacna1fQ9JIS7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cacna1fQ9JIS7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cacna1fQ9JIS7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cacna1fQ9JIS7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cacna1fQ9JIS7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cacna1fQ9JIS7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cacna1fQ9JIS7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cacna1fQ9JIS7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cacna1fQ9JIS7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cacna1fQ9JIS7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cacna1fQ9JIS7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cacna1fQ9JIS7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cacna1fQ9JIS7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cacna1fQ9JIS7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cacna1fQ9JIS7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cacna1fQ9JIS7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cacna1fQ9JIS7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cacna1fQ9JIS7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cacna1fQ9JIS7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cacna1fQ9JIS7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cacna1fQ9JIS7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cacna1fQ9JIS7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cacna1fQ9JIS7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cacna1fQ9JIS7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cacna1fQ9JIS7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cacna1fQ9JIS7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cacna1fQ9JIS7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cacna1fQ9JIS7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cacna1fQ9JIS7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cacna1fQ9JIS7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cacna1fQ9JIS7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cacna1fQ9JIS7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Cacna1fQ9JIS7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cacna1fQ9JIS7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cacna1fQ9JIS7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cacna1fQ9JIS7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cacna1fQ9JIS7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cacna1fQ9JIS7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cacna1fQ9JIS7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Cacna1fQ9JIS7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cacna1fQ9JIS7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cacna1fQ9JIS7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cacna1fQ9JIS7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cacna1fQ9JIS7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cacna1fQ9JIS7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cacna1fQ9JIS7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cacna1fQ9JIS7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cacna1fQ9JIS7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cacna1fQ9JIS7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cacna1fQ9JIS7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Cacna1fQ9JIS7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cacna1fQ9JIS7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cacna1fQ9JIS7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cacna1fQ9JIS7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cacna1fQ9JIS7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Cacna1fQ9JIS7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cacna1fQ9JIS7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Cacna1fQ9JIS7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cacna1fQ9JIS7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cacna1fQ9JIS7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Cacna1fQ9JIS7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cacna1fQ9JIS7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cacna1fQ9JIS7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cacna1fQ9JIS7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cacna1fQ9JIS7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cacna1fQ9JIS7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cacna1fQ9JIS7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cacna1fQ9JIS7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms