Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc22Q9JIG7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc22Q9JIG7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc22Q9JIG7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc22Q9JIG7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc22Q9JIG7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc22Q9JIG7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc22Q9JIG7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc22Q9JIG7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc22Q9JIG7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc22Q9JIG7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc22Q9JIG7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc22Q9JIG7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc22Q9JIG7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc22Q9JIG7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc22Q9JIG7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc22Q9JIG7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc22Q9JIG7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc22Q9JIG7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc22Q9JIG7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc22Q9JIG7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc22Q9JIG7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc22Q9JIG7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc22Q9JIG7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc22Q9JIG7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc22Q9JIG7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc22Q9JIG7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc22Q9JIG7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc22Q9JIG7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc22Q9JIG7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc22Q9JIG7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc22Q9JIG7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc22Q9JIG7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc22Q9JIG7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc22Q9JIG7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc22Q9JIG7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc22Q9JIG7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc22Q9JIG7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc22Q9JIG7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc22Q9JIG7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc22Q9JIG7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc22Q9JIG7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc22Q9JIG7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc22Q9JIG7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc22Q9JIG7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc22Q9JIG7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc22Q9JIG7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc22Q9JIG7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc22Q9JIG7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc22Q9JIG7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc22Q9JIG7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc22Q9JIG7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc22Q9JIG7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc22Q9JIG7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc22Q9JIG7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc22Q9JIG7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc22Q9JIG7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc22Q9JIG7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc22Q9JIG7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc22Q9JIG7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc22Q9JIG7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc22Q9JIG7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc22Q9JIG7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc22Q9JIG7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc22Q9JIG7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc22Q9JIG7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc22Q9JIG7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc22Q9JIG7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc22Q9JIG7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc22Q9JIG7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc22Q9JIG7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc22Q9JIG7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc22Q9JIG7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc22Q9JIG7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc22Q9JIG7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc22Q9JIG7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc22Q9JIG7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc22Q9JIG7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc22Q9JIG7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc22Q9JIG7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc22Q9JIG7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc22Q9JIG7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc22Q9JIG7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc22Q9JIG7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc22Q9JIG7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc22Q9JIG7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc22Q9JIG7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc22Q9JIG7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc22Q9JIG7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc22Q9JIG7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc22Q9JIG7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc22Q9JIG7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc22Q9JIG7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc22Q9JIG7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc22Q9JIG7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc22Q9JIG7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc22Q9JIG7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc22Q9JIG7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc22Q9JIG7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc22Q9JIG7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms