Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA7

Sphk2, Sphingosine kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sphk2Q9JIA7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sphk2Q9JIA7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sphk2Q9JIA7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sphk2Q9JIA7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sphk2Q9JIA7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sphk2Q9JIA7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sphk2Q9JIA7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sphk2Q9JIA7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sphk2Q9JIA7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sphk2Q9JIA7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sphk2Q9JIA7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sphk2Q9JIA7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sphk2Q9JIA7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sphk2Q9JIA7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sphk2Q9JIA7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sphk2Q9JIA7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sphk2Q9JIA7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sphk2Q9JIA7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sphk2Q9JIA7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sphk2Q9JIA7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sphk2Q9JIA7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sphk2Q9JIA7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sphk2Q9JIA7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sphk2Q9JIA7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sphk2Q9JIA7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sphk2Q9JIA7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sphk2Q9JIA7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sphk2Q9JIA7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sphk2Q9JIA7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sphk2Q9JIA7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sphk2Q9JIA7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sphk2Q9JIA7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sphk2Q9JIA7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sphk2Q9JIA7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sphk2Q9JIA7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sphk2Q9JIA7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sphk2Q9JIA7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sphk2Q9JIA7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sphk2Q9JIA7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sphk2Q9JIA7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sphk2Q9JIA7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sphk2Q9JIA7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sphk2Q9JIA7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sphk2Q9JIA7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sphk2Q9JIA7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sphk2Q9JIA7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sphk2Q9JIA7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sphk2Q9JIA7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sphk2Q9JIA7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sphk2Q9JIA7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sphk2Q9JIA7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sphk2Q9JIA7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sphk2Q9JIA7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sphk2Q9JIA7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sphk2Q9JIA7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sphk2Q9JIA7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sphk2Q9JIA7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sphk2Q9JIA7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sphk2Q9JIA7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sphk2Q9JIA7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sphk2Q9JIA7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sphk2Q9JIA7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sphk2Q9JIA7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sphk2Q9JIA7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sphk2Q9JIA7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sphk2Q9JIA7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sphk2Q9JIA7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sphk2Q9JIA7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sphk2Q9JIA7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sphk2Q9JIA7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sphk2Q9JIA7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sphk2Q9JIA7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sphk2Q9JIA7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sphk2Q9JIA7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sphk2Q9JIA7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sphk2Q9JIA7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sphk2Q9JIA7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sphk2Q9JIA7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sphk2Q9JIA7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sphk2Q9JIA7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sphk2Q9JIA7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sphk2Q9JIA7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sphk2Q9JIA7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sphk2Q9JIA7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sphk2Q9JIA7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sphk2Q9JIA7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sphk2Q9JIA7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sphk2Q9JIA7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sphk2Q9JIA7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sphk2Q9JIA7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sphk2Q9JIA7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sphk2Q9JIA7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sphk2Q9JIA7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sphk2Q9JIA7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sphk2Q9JIA7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sphk2Q9JIA7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sphk2Q9JIA7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sphk2Q9JIA7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sphk2Q9JIA7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sphk2Q9JIA7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms