Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cldn19Q9ET38 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cldn19Q9ET38 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cldn19Q9ET38 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cldn19Q9ET38 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cldn19Q9ET38 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cldn19Q9ET38 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cldn19Q9ET38 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cldn19Q9ET38 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cldn19Q9ET38 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cldn19Q9ET38 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cldn19Q9ET38 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cldn19Q9ET38 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cldn19Q9ET38 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cldn19Q9ET38 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cldn19Q9ET38 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cldn19Q9ET38 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cldn19Q9ET38 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cldn19Q9ET38 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cldn19Q9ET38 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cldn19Q9ET38 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cldn19Q9ET38 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cldn19Q9ET38 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cldn19Q9ET38 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cldn19Q9ET38 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cldn19Q9ET38 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cldn19Q9ET38 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cldn19Q9ET38 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cldn19Q9ET38 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cldn19Q9ET38 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cldn19Q9ET38 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cldn19Q9ET38 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cldn19Q9ET38 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cldn19Q9ET38 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cldn19Q9ET38 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cldn19Q9ET38 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cldn19Q9ET38 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cldn19Q9ET38 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cldn19Q9ET38 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cldn19Q9ET38 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cldn19Q9ET38 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cldn19Q9ET38 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cldn19Q9ET38 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cldn19Q9ET38 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cldn19Q9ET38 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cldn19Q9ET38 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cldn19Q9ET38 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cldn19Q9ET38 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cldn19Q9ET38 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cldn19Q9ET38 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cldn19Q9ET38 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cldn19Q9ET38 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cldn19Q9ET38 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cldn19Q9ET38 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cldn19Q9ET38 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cldn19Q9ET38 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cldn19Q9ET38 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cldn19Q9ET38 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cldn19Q9ET38 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cldn19Q9ET38 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cldn19Q9ET38 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cldn19Q9ET38 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cldn19Q9ET38 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cldn19Q9ET38 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cldn19Q9ET38 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cldn19Q9ET38 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cldn19Q9ET38 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cldn19Q9ET38 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cldn19Q9ET38 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cldn19Q9ET38 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cldn19Q9ET38 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cldn19Q9ET38 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cldn19Q9ET38 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cldn19Q9ET38 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cldn19Q9ET38 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cldn19Q9ET38 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cldn19Q9ET38 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cldn19Q9ET38 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cldn19Q9ET38 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cldn19Q9ET38 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cldn19Q9ET38 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cldn19Q9ET38 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cldn19Q9ET38 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cldn19Q9ET38 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cldn19Q9ET38 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cldn19Q9ET38 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cldn19Q9ET38 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cldn19Q9ET38 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cldn19Q9ET38 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cldn19Q9ET38 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cldn19Q9ET38 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cldn19Q9ET38 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cldn19Q9ET38 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cldn19Q9ET38 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cldn19Q9ET38 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cldn19Q9ET38 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cldn19Q9ET38 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cldn19Q9ET38 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cldn19Q9ET38 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cldn19Q9ET38 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms