Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESZ8

Gtf2i, General transcription factor II-I, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2iQ9ESZ8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Gtf2iQ9ESZ8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Gtf2iQ9ESZ8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Gtf2iQ9ESZ8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29,48■■■□□ 2,31
Gtf2iQ9ESZ8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Gtf2iQ9ESZ8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Gtf2iQ9ESZ8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Gtf2iQ9ESZ8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Gtf2iQ9ESZ8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Gtf2iQ9ESZ8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Gtf2iQ9ESZ8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Gtf2iQ9ESZ8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29,44■■■□□ 2,3
Gtf2iQ9ESZ8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Gtf2iQ9ESZ8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Gtf2iQ9ESZ8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Gtf2iQ9ESZ8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Gtf2iQ9ESZ8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Gtf2iQ9ESZ8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Gtf2iQ9ESZ8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Gtf2iQ9ESZ8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Gtf2iQ9ESZ8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,29
Gtf2iQ9ESZ8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,29
Gtf2iQ9ESZ8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Gtf2iQ9ESZ8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Gtf2iQ9ESZ8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Gtf2iQ9ESZ8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Gtf2iQ9ESZ8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Gtf2iQ9ESZ8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Gtf2iQ9ESZ8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29,36■■■□□ 2,29
Gtf2iQ9ESZ8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Gtf2iQ9ESZ8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Gtf2iQ9ESZ8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Gtf2iQ9ESZ8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Gtf2iQ9ESZ8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29,33■■■□□ 2,29
Gtf2iQ9ESZ8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29,33■■■□□ 2,29
Gtf2iQ9ESZ8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Gtf2iQ9ESZ8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Gtf2iQ9ESZ8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Gtf2iQ9ESZ8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Gtf2iQ9ESZ8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Gtf2iQ9ESZ8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Gtf2iQ9ESZ8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Gtf2iQ9ESZ8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Gtf2iQ9ESZ8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Gtf2iQ9ESZ8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Gtf2iQ9ESZ8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Gtf2iQ9ESZ8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Gtf2iQ9ESZ8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Gtf2iQ9ESZ8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Gtf2iQ9ESZ8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Gtf2iQ9ESZ8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Gtf2iQ9ESZ8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Gtf2iQ9ESZ8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Gtf2iQ9ESZ8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Gtf2iQ9ESZ8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Gtf2iQ9ESZ8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Gtf2iQ9ESZ8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Gtf2iQ9ESZ8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Gtf2iQ9ESZ8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Gtf2iQ9ESZ8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Gtf2iQ9ESZ8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Gtf2iQ9ESZ8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Gtf2iQ9ESZ8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Gtf2iQ9ESZ8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Gtf2iQ9ESZ8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Gtf2iQ9ESZ8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Gtf2iQ9ESZ8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Gtf2iQ9ESZ8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Gtf2iQ9ESZ8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Gtf2iQ9ESZ8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Gtf2iQ9ESZ8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Gtf2iQ9ESZ8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Gtf2iQ9ESZ8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29,1■■■□□ 2,25
Gtf2iQ9ESZ8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Gtf2iQ9ESZ8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Gtf2iQ9ESZ8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Gtf2iQ9ESZ8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29,09■■■□□ 2,25
Gtf2iQ9ESZ8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Gtf2iQ9ESZ8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Gtf2iQ9ESZ8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Gtf2iQ9ESZ8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29,08■■■□□ 2,25
Gtf2iQ9ESZ8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Gtf2iQ9ESZ8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Gtf2iQ9ESZ8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Gtf2iQ9ESZ8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Gtf2iQ9ESZ8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Gtf2iQ9ESZ8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29,06■■■□□ 2,24
Gtf2iQ9ESZ8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Gtf2iQ9ESZ8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Gtf2iQ9ESZ8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Gtf2iQ9ESZ8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Gtf2iQ9ESZ8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Gtf2iQ9ESZ8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Gtf2iQ9ESZ8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Gtf2iQ9ESZ8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Gtf2iQ9ESZ8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28,99■■■□□ 2,23
Gtf2iQ9ESZ8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Gtf2iQ9ESZ8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Gtf2iQ9ESZ8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Gtf2iQ9ESZ8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms