Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cpsf1Q9EPU4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Cpsf1Q9EPU4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cpsf1Q9EPU4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cpsf1Q9EPU4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cpsf1Q9EPU4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cpsf1Q9EPU4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cpsf1Q9EPU4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Cpsf1Q9EPU4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cpsf1Q9EPU4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cpsf1Q9EPU4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cpsf1Q9EPU4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cpsf1Q9EPU4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cpsf1Q9EPU4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cpsf1Q9EPU4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cpsf1Q9EPU4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Cpsf1Q9EPU4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Cpsf1Q9EPU4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cpsf1Q9EPU4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cpsf1Q9EPU4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cpsf1Q9EPU4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cpsf1Q9EPU4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cpsf1Q9EPU4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cpsf1Q9EPU4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cpsf1Q9EPU4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cpsf1Q9EPU4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cpsf1Q9EPU4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cpsf1Q9EPU4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cpsf1Q9EPU4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cpsf1Q9EPU4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cpsf1Q9EPU4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Cpsf1Q9EPU4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cpsf1Q9EPU4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cpsf1Q9EPU4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cpsf1Q9EPU4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cpsf1Q9EPU4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cpsf1Q9EPU4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Cpsf1Q9EPU4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cpsf1Q9EPU4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cpsf1Q9EPU4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cpsf1Q9EPU4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cpsf1Q9EPU4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cpsf1Q9EPU4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Cpsf1Q9EPU4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cpsf1Q9EPU4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cpsf1Q9EPU4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cpsf1Q9EPU4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cpsf1Q9EPU4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cpsf1Q9EPU4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cpsf1Q9EPU4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cpsf1Q9EPU4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cpsf1Q9EPU4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cpsf1Q9EPU4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cpsf1Q9EPU4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cpsf1Q9EPU4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cpsf1Q9EPU4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cpsf1Q9EPU4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cpsf1Q9EPU4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cpsf1Q9EPU4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cpsf1Q9EPU4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cpsf1Q9EPU4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cpsf1Q9EPU4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cpsf1Q9EPU4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cpsf1Q9EPU4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cpsf1Q9EPU4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cpsf1Q9EPU4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cpsf1Q9EPU4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cpsf1Q9EPU4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cpsf1Q9EPU4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Cpsf1Q9EPU4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Cpsf1Q9EPU4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Cpsf1Q9EPU4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cpsf1Q9EPU4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cpsf1Q9EPU4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cpsf1Q9EPU4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cpsf1Q9EPU4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cpsf1Q9EPU4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cpsf1Q9EPU4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Cpsf1Q9EPU4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Cpsf1Q9EPU4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cpsf1Q9EPU4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cpsf1Q9EPU4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cpsf1Q9EPU4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cpsf1Q9EPU4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cpsf1Q9EPU4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Cpsf1Q9EPU4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Cpsf1Q9EPU4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cpsf1Q9EPU4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cpsf1Q9EPU4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cpsf1Q9EPU4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cpsf1Q9EPU4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cpsf1Q9EPU4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cpsf1Q9EPU4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cpsf1Q9EPU4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Cpsf1Q9EPU4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cpsf1Q9EPU4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cpsf1Q9EPU4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cpsf1Q9EPU4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cpsf1Q9EPU4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cpsf1Q9EPU4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms