Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK8

Trpv4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv4Q9EPK8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpv4Q9EPK8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpv4Q9EPK8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpv4Q9EPK8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpv4Q9EPK8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trpv4Q9EPK8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpv4Q9EPK8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpv4Q9EPK8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpv4Q9EPK8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpv4Q9EPK8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpv4Q9EPK8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpv4Q9EPK8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpv4Q9EPK8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpv4Q9EPK8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpv4Q9EPK8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpv4Q9EPK8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpv4Q9EPK8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpv4Q9EPK8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpv4Q9EPK8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpv4Q9EPK8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpv4Q9EPK8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpv4Q9EPK8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpv4Q9EPK8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpv4Q9EPK8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpv4Q9EPK8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpv4Q9EPK8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpv4Q9EPK8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpv4Q9EPK8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trpv4Q9EPK8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpv4Q9EPK8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpv4Q9EPK8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpv4Q9EPK8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpv4Q9EPK8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpv4Q9EPK8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpv4Q9EPK8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpv4Q9EPK8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpv4Q9EPK8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpv4Q9EPK8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpv4Q9EPK8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpv4Q9EPK8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpv4Q9EPK8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpv4Q9EPK8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trpv4Q9EPK8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpv4Q9EPK8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpv4Q9EPK8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpv4Q9EPK8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpv4Q9EPK8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpv4Q9EPK8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpv4Q9EPK8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpv4Q9EPK8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpv4Q9EPK8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpv4Q9EPK8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpv4Q9EPK8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpv4Q9EPK8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpv4Q9EPK8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpv4Q9EPK8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpv4Q9EPK8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpv4Q9EPK8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpv4Q9EPK8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpv4Q9EPK8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpv4Q9EPK8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpv4Q9EPK8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpv4Q9EPK8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpv4Q9EPK8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpv4Q9EPK8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpv4Q9EPK8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpv4Q9EPK8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpv4Q9EPK8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpv4Q9EPK8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpv4Q9EPK8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpv4Q9EPK8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpv4Q9EPK8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpv4Q9EPK8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpv4Q9EPK8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpv4Q9EPK8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpv4Q9EPK8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpv4Q9EPK8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpv4Q9EPK8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpv4Q9EPK8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpv4Q9EPK8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpv4Q9EPK8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpv4Q9EPK8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpv4Q9EPK8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpv4Q9EPK8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpv4Q9EPK8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trpv4Q9EPK8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpv4Q9EPK8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpv4Q9EPK8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpv4Q9EPK8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpv4Q9EPK8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpv4Q9EPK8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpv4Q9EPK8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpv4Q9EPK8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpv4Q9EPK8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpv4Q9EPK8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpv4Q9EPK8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpv4Q9EPK8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpv4Q9EPK8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpv4Q9EPK8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpv4Q9EPK8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms