Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgn3Q9DCB1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgn3Q9DCB1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgn3Q9DCB1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgn3Q9DCB1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgn3Q9DCB1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgn3Q9DCB1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgn3Q9DCB1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmgn3Q9DCB1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmgn3Q9DCB1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgn3Q9DCB1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgn3Q9DCB1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmgn3Q9DCB1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmgn3Q9DCB1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmgn3Q9DCB1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmgn3Q9DCB1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmgn3Q9DCB1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmgn3Q9DCB1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmgn3Q9DCB1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmgn3Q9DCB1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmgn3Q9DCB1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmgn3Q9DCB1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmgn3Q9DCB1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgn3Q9DCB1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgn3Q9DCB1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgn3Q9DCB1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmgn3Q9DCB1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmgn3Q9DCB1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmgn3Q9DCB1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmgn3Q9DCB1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hmgn3Q9DCB1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hmgn3Q9DCB1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmgn3Q9DCB1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgn3Q9DCB1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgn3Q9DCB1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgn3Q9DCB1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgn3Q9DCB1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgn3Q9DCB1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgn3Q9DCB1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgn3Q9DCB1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgn3Q9DCB1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgn3Q9DCB1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgn3Q9DCB1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgn3Q9DCB1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgn3Q9DCB1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgn3Q9DCB1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgn3Q9DCB1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgn3Q9DCB1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgn3Q9DCB1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgn3Q9DCB1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmgn3Q9DCB1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgn3Q9DCB1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgn3Q9DCB1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgn3Q9DCB1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgn3Q9DCB1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgn3Q9DCB1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgn3Q9DCB1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgn3Q9DCB1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgn3Q9DCB1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgn3Q9DCB1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgn3Q9DCB1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmgn3Q9DCB1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmgn3Q9DCB1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmgn3Q9DCB1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmgn3Q9DCB1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmgn3Q9DCB1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmgn3Q9DCB1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgn3Q9DCB1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmgn3Q9DCB1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmgn3Q9DCB1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmgn3Q9DCB1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmgn3Q9DCB1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmgn3Q9DCB1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmgn3Q9DCB1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmgn3Q9DCB1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmgn3Q9DCB1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmgn3Q9DCB1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmgn3Q9DCB1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmgn3Q9DCB1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmgn3Q9DCB1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmgn3Q9DCB1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmgn3Q9DCB1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmgn3Q9DCB1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmgn3Q9DCB1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmgn3Q9DCB1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmgn3Q9DCB1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmgn3Q9DCB1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmgn3Q9DCB1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmgn3Q9DCB1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmgn3Q9DCB1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmgn3Q9DCB1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmgn3Q9DCB1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmgn3Q9DCB1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmgn3Q9DCB1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmgn3Q9DCB1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmgn3Q9DCB1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmgn3Q9DCB1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmgn3Q9DCB1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmgn3Q9DCB1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmgn3Q9DCB1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms