Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Syde1Q9DBZ9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syde1Q9DBZ9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Syde1Q9DBZ9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syde1Q9DBZ9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syde1Q9DBZ9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syde1Q9DBZ9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syde1Q9DBZ9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syde1Q9DBZ9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syde1Q9DBZ9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syde1Q9DBZ9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syde1Q9DBZ9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syde1Q9DBZ9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syde1Q9DBZ9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syde1Q9DBZ9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syde1Q9DBZ9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syde1Q9DBZ9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syde1Q9DBZ9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syde1Q9DBZ9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syde1Q9DBZ9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syde1Q9DBZ9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Syde1Q9DBZ9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Syde1Q9DBZ9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Syde1Q9DBZ9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Syde1Q9DBZ9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Syde1Q9DBZ9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Syde1Q9DBZ9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Syde1Q9DBZ9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Syde1Q9DBZ9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Syde1Q9DBZ9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Syde1Q9DBZ9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syde1Q9DBZ9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Syde1Q9DBZ9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Syde1Q9DBZ9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Syde1Q9DBZ9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syde1Q9DBZ9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syde1Q9DBZ9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syde1Q9DBZ9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syde1Q9DBZ9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syde1Q9DBZ9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syde1Q9DBZ9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Syde1Q9DBZ9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syde1Q9DBZ9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syde1Q9DBZ9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syde1Q9DBZ9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Syde1Q9DBZ9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Syde1Q9DBZ9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Syde1Q9DBZ9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syde1Q9DBZ9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syde1Q9DBZ9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Syde1Q9DBZ9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syde1Q9DBZ9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syde1Q9DBZ9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syde1Q9DBZ9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syde1Q9DBZ9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syde1Q9DBZ9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Syde1Q9DBZ9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Syde1Q9DBZ9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Syde1Q9DBZ9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Syde1Q9DBZ9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Syde1Q9DBZ9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Syde1Q9DBZ9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Syde1Q9DBZ9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Syde1Q9DBZ9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syde1Q9DBZ9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syde1Q9DBZ9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syde1Q9DBZ9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Syde1Q9DBZ9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Syde1Q9DBZ9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Syde1Q9DBZ9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Syde1Q9DBZ9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syde1Q9DBZ9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syde1Q9DBZ9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Syde1Q9DBZ9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syde1Q9DBZ9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Syde1Q9DBZ9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Syde1Q9DBZ9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Syde1Q9DBZ9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Syde1Q9DBZ9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Syde1Q9DBZ9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syde1Q9DBZ9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syde1Q9DBZ9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syde1Q9DBZ9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syde1Q9DBZ9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Syde1Q9DBZ9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syde1Q9DBZ9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syde1Q9DBZ9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syde1Q9DBZ9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Syde1Q9DBZ9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Syde1Q9DBZ9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Syde1Q9DBZ9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Syde1Q9DBZ9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Syde1Q9DBZ9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Syde1Q9DBZ9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Syde1Q9DBZ9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Syde1Q9DBZ9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Syde1Q9DBZ9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syde1Q9DBZ9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syde1Q9DBZ9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms