Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp12Q9D9M2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp12Q9D9M2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp12Q9D9M2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp12Q9D9M2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp12Q9D9M2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp12Q9D9M2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp12Q9D9M2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp12Q9D9M2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp12Q9D9M2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp12Q9D9M2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp12Q9D9M2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp12Q9D9M2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp12Q9D9M2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp12Q9D9M2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp12Q9D9M2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp12Q9D9M2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp12Q9D9M2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp12Q9D9M2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp12Q9D9M2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp12Q9D9M2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp12Q9D9M2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp12Q9D9M2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp12Q9D9M2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp12Q9D9M2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp12Q9D9M2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp12Q9D9M2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp12Q9D9M2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp12Q9D9M2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp12Q9D9M2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp12Q9D9M2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp12Q9D9M2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp12Q9D9M2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp12Q9D9M2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp12Q9D9M2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp12Q9D9M2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp12Q9D9M2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp12Q9D9M2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp12Q9D9M2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp12Q9D9M2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp12Q9D9M2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp12Q9D9M2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp12Q9D9M2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp12Q9D9M2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp12Q9D9M2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp12Q9D9M2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp12Q9D9M2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp12Q9D9M2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp12Q9D9M2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp12Q9D9M2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp12Q9D9M2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp12Q9D9M2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp12Q9D9M2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp12Q9D9M2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp12Q9D9M2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp12Q9D9M2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp12Q9D9M2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp12Q9D9M2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp12Q9D9M2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp12Q9D9M2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp12Q9D9M2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp12Q9D9M2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp12Q9D9M2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp12Q9D9M2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp12Q9D9M2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp12Q9D9M2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp12Q9D9M2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp12Q9D9M2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp12Q9D9M2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp12Q9D9M2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp12Q9D9M2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp12Q9D9M2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp12Q9D9M2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp12Q9D9M2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp12Q9D9M2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp12Q9D9M2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp12Q9D9M2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp12Q9D9M2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp12Q9D9M2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp12Q9D9M2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp12Q9D9M2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp12Q9D9M2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp12Q9D9M2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp12Q9D9M2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp12Q9D9M2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp12Q9D9M2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp12Q9D9M2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp12Q9D9M2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp12Q9D9M2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp12Q9D9M2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp12Q9D9M2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp12Q9D9M2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp12Q9D9M2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp12Q9D9M2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp12Q9D9M2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp12Q9D9M2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp12Q9D9M2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp12Q9D9M2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp12Q9D9M2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp12Q9D9M2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms