Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SlirpQ9D8T7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SlirpQ9D8T7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SlirpQ9D8T7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SlirpQ9D8T7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SlirpQ9D8T7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SlirpQ9D8T7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SlirpQ9D8T7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SlirpQ9D8T7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SlirpQ9D8T7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SlirpQ9D8T7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SlirpQ9D8T7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SlirpQ9D8T7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SlirpQ9D8T7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SlirpQ9D8T7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SlirpQ9D8T7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SlirpQ9D8T7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SlirpQ9D8T7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SlirpQ9D8T7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SlirpQ9D8T7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SlirpQ9D8T7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SlirpQ9D8T7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SlirpQ9D8T7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SlirpQ9D8T7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SlirpQ9D8T7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SlirpQ9D8T7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SlirpQ9D8T7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SlirpQ9D8T7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SlirpQ9D8T7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SlirpQ9D8T7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SlirpQ9D8T7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SlirpQ9D8T7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SlirpQ9D8T7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SlirpQ9D8T7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SlirpQ9D8T7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SlirpQ9D8T7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SlirpQ9D8T7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SlirpQ9D8T7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SlirpQ9D8T7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SlirpQ9D8T7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SlirpQ9D8T7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SlirpQ9D8T7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SlirpQ9D8T7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SlirpQ9D8T7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SlirpQ9D8T7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SlirpQ9D8T7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SlirpQ9D8T7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SlirpQ9D8T7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SlirpQ9D8T7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SlirpQ9D8T7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SlirpQ9D8T7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SlirpQ9D8T7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SlirpQ9D8T7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SlirpQ9D8T7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SlirpQ9D8T7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SlirpQ9D8T7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SlirpQ9D8T7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SlirpQ9D8T7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SlirpQ9D8T7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SlirpQ9D8T7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SlirpQ9D8T7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SlirpQ9D8T7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SlirpQ9D8T7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SlirpQ9D8T7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SlirpQ9D8T7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SlirpQ9D8T7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SlirpQ9D8T7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SlirpQ9D8T7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SlirpQ9D8T7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SlirpQ9D8T7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SlirpQ9D8T7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SlirpQ9D8T7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SlirpQ9D8T7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SlirpQ9D8T7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SlirpQ9D8T7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SlirpQ9D8T7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SlirpQ9D8T7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SlirpQ9D8T7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SlirpQ9D8T7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SlirpQ9D8T7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SlirpQ9D8T7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SlirpQ9D8T7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SlirpQ9D8T7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SlirpQ9D8T7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SlirpQ9D8T7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SlirpQ9D8T7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SlirpQ9D8T7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SlirpQ9D8T7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SlirpQ9D8T7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SlirpQ9D8T7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SlirpQ9D8T7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SlirpQ9D8T7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SlirpQ9D8T7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SlirpQ9D8T7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SlirpQ9D8T7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SlirpQ9D8T7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SlirpQ9D8T7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SlirpQ9D8T7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SlirpQ9D8T7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SlirpQ9D8T7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.7 ms