Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Chmp4bQ9D8B3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Chmp4bQ9D8B3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Chmp4bQ9D8B3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Chmp4bQ9D8B3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Chmp4bQ9D8B3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Chmp4bQ9D8B3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Chmp4bQ9D8B3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Chmp4bQ9D8B3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Chmp4bQ9D8B3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Chmp4bQ9D8B3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Chmp4bQ9D8B3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Chmp4bQ9D8B3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Chmp4bQ9D8B3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Chmp4bQ9D8B3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Chmp4bQ9D8B3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Chmp4bQ9D8B3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Chmp4bQ9D8B3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Chmp4bQ9D8B3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Chmp4bQ9D8B3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Chmp4bQ9D8B3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Chmp4bQ9D8B3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Chmp4bQ9D8B3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Chmp4bQ9D8B3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Chmp4bQ9D8B3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Chmp4bQ9D8B3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Chmp4bQ9D8B3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Chmp4bQ9D8B3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Chmp4bQ9D8B3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Chmp4bQ9D8B3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Chmp4bQ9D8B3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Chmp4bQ9D8B3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Chmp4bQ9D8B3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Chmp4bQ9D8B3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Chmp4bQ9D8B3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Chmp4bQ9D8B3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Chmp4bQ9D8B3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Chmp4bQ9D8B3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Chmp4bQ9D8B3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Chmp4bQ9D8B3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Chmp4bQ9D8B3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Chmp4bQ9D8B3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Chmp4bQ9D8B3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Chmp4bQ9D8B3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Chmp4bQ9D8B3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Chmp4bQ9D8B3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Chmp4bQ9D8B3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Chmp4bQ9D8B3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Chmp4bQ9D8B3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Chmp4bQ9D8B3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Chmp4bQ9D8B3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Chmp4bQ9D8B3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Chmp4bQ9D8B3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Chmp4bQ9D8B3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Chmp4bQ9D8B3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Chmp4bQ9D8B3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Chmp4bQ9D8B3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Chmp4bQ9D8B3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Chmp4bQ9D8B3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Chmp4bQ9D8B3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Chmp4bQ9D8B3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Chmp4bQ9D8B3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Chmp4bQ9D8B3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Chmp4bQ9D8B3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Chmp4bQ9D8B3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Chmp4bQ9D8B3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Chmp4bQ9D8B3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Chmp4bQ9D8B3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Chmp4bQ9D8B3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Chmp4bQ9D8B3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Chmp4bQ9D8B3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Chmp4bQ9D8B3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Chmp4bQ9D8B3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chmp4bQ9D8B3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chmp4bQ9D8B3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chmp4bQ9D8B3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Chmp4bQ9D8B3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Chmp4bQ9D8B3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Chmp4bQ9D8B3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Chmp4bQ9D8B3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Chmp4bQ9D8B3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Chmp4bQ9D8B3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Chmp4bQ9D8B3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Chmp4bQ9D8B3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Chmp4bQ9D8B3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Chmp4bQ9D8B3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Chmp4bQ9D8B3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Chmp4bQ9D8B3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Chmp4bQ9D8B3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Chmp4bQ9D8B3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Chmp4bQ9D8B3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Chmp4bQ9D8B3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Chmp4bQ9D8B3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Chmp4bQ9D8B3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Chmp4bQ9D8B3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Chmp4bQ9D8B3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Chmp4bQ9D8B3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms