Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5F6

4930447A16Rik, RIKEN cDNA 4930447A16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447A16RikQ9D5F6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930447A16RikQ9D5F6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930447A16RikQ9D5F6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930447A16RikQ9D5F6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930447A16RikQ9D5F6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930447A16RikQ9D5F6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930447A16RikQ9D5F6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930447A16RikQ9D5F6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930447A16RikQ9D5F6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930447A16RikQ9D5F6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930447A16RikQ9D5F6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930447A16RikQ9D5F6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930447A16RikQ9D5F6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930447A16RikQ9D5F6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930447A16RikQ9D5F6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930447A16RikQ9D5F6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930447A16RikQ9D5F6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
4930447A16RikQ9D5F6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930447A16RikQ9D5F6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930447A16RikQ9D5F6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930447A16RikQ9D5F6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930447A16RikQ9D5F6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930447A16RikQ9D5F6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930447A16RikQ9D5F6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930447A16RikQ9D5F6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930447A16RikQ9D5F6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930447A16RikQ9D5F6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930447A16RikQ9D5F6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930447A16RikQ9D5F6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930447A16RikQ9D5F6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930447A16RikQ9D5F6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930447A16RikQ9D5F6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930447A16RikQ9D5F6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930447A16RikQ9D5F6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930447A16RikQ9D5F6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930447A16RikQ9D5F6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930447A16RikQ9D5F6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930447A16RikQ9D5F6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930447A16RikQ9D5F6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930447A16RikQ9D5F6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930447A16RikQ9D5F6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930447A16RikQ9D5F6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930447A16RikQ9D5F6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930447A16RikQ9D5F6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930447A16RikQ9D5F6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930447A16RikQ9D5F6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930447A16RikQ9D5F6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930447A16RikQ9D5F6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930447A16RikQ9D5F6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930447A16RikQ9D5F6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930447A16RikQ9D5F6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930447A16RikQ9D5F6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930447A16RikQ9D5F6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930447A16RikQ9D5F6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930447A16RikQ9D5F6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
4930447A16RikQ9D5F6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930447A16RikQ9D5F6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930447A16RikQ9D5F6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930447A16RikQ9D5F6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930447A16RikQ9D5F6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930447A16RikQ9D5F6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930447A16RikQ9D5F6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930447A16RikQ9D5F6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930447A16RikQ9D5F6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930447A16RikQ9D5F6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930447A16RikQ9D5F6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930447A16RikQ9D5F6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930447A16RikQ9D5F6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930447A16RikQ9D5F6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930447A16RikQ9D5F6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930447A16RikQ9D5F6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
4930447A16RikQ9D5F6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
4930447A16RikQ9D5F6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930447A16RikQ9D5F6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930447A16RikQ9D5F6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930447A16RikQ9D5F6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930447A16RikQ9D5F6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930447A16RikQ9D5F6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930447A16RikQ9D5F6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930447A16RikQ9D5F6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930447A16RikQ9D5F6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930447A16RikQ9D5F6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930447A16RikQ9D5F6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930447A16RikQ9D5F6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930447A16RikQ9D5F6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930447A16RikQ9D5F6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930447A16RikQ9D5F6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930447A16RikQ9D5F6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930447A16RikQ9D5F6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930447A16RikQ9D5F6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930447A16RikQ9D5F6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930447A16RikQ9D5F6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930447A16RikQ9D5F6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930447A16RikQ9D5F6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930447A16RikQ9D5F6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
4930447A16RikQ9D5F6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930447A16RikQ9D5F6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930447A16RikQ9D5F6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930447A16RikQ9D5F6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930447A16RikQ9D5F6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms