Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F8

Toporsl, Topoisomerase I-binding, arginine/serine-rich-like, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ToporslQ9D2F8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
ToporslQ9D2F8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
ToporslQ9D2F8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
ToporslQ9D2F8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
ToporslQ9D2F8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25,4■■□□□ 1,66
ToporslQ9D2F8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
ToporslQ9D2F8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
ToporslQ9D2F8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
ToporslQ9D2F8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
ToporslQ9D2F8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
ToporslQ9D2F8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
ToporslQ9D2F8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25,36■■□□□ 1,65
ToporslQ9D2F8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
ToporslQ9D2F8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
ToporslQ9D2F8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
ToporslQ9D2F8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
ToporslQ9D2F8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
ToporslQ9D2F8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
ToporslQ9D2F8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
ToporslQ9D2F8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
ToporslQ9D2F8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
ToporslQ9D2F8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
ToporslQ9D2F8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25,31■■□□□ 1,64
ToporslQ9D2F8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
ToporslQ9D2F8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
ToporslQ9D2F8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
ToporslQ9D2F8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
ToporslQ9D2F8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
ToporslQ9D2F8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
ToporslQ9D2F8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25,28■■□□□ 1,64
ToporslQ9D2F8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
ToporslQ9D2F8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
ToporslQ9D2F8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
ToporslQ9D2F8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
ToporslQ9D2F8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25,26■■□□□ 1,63
ToporslQ9D2F8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
ToporslQ9D2F8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
ToporslQ9D2F8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
ToporslQ9D2F8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,24■■□□□ 1,63
ToporslQ9D2F8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
ToporslQ9D2F8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25,22■■□□□ 1,63
ToporslQ9D2F8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
ToporslQ9D2F8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
ToporslQ9D2F8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
ToporslQ9D2F8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25,21■■□□□ 1,63
ToporslQ9D2F8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,21■■□□□ 1,63
ToporslQ9D2F8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
ToporslQ9D2F8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
ToporslQ9D2F8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
ToporslQ9D2F8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25,2■■□□□ 1,62
ToporslQ9D2F8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,62
ToporslQ9D2F8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
ToporslQ9D2F8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25,2■■□□□ 1,62
ToporslQ9D2F8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
ToporslQ9D2F8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
ToporslQ9D2F8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
ToporslQ9D2F8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
ToporslQ9D2F8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
ToporslQ9D2F8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25,16■■□□□ 1,62
ToporslQ9D2F8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25,16■■□□□ 1,62
ToporslQ9D2F8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25,16■■□□□ 1,62
ToporslQ9D2F8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
ToporslQ9D2F8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
ToporslQ9D2F8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
ToporslQ9D2F8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
ToporslQ9D2F8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,13■■□□□ 1,61
ToporslQ9D2F8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
ToporslQ9D2F8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
ToporslQ9D2F8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25,13■■□□□ 1,61
ToporslQ9D2F8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,13■■□□□ 1,61
ToporslQ9D2F8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
ToporslQ9D2F8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
ToporslQ9D2F8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
ToporslQ9D2F8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
ToporslQ9D2F8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
ToporslQ9D2F8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
ToporslQ9D2F8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25,11■■□□□ 1,61
ToporslQ9D2F8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
ToporslQ9D2F8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
ToporslQ9D2F8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25,09■■□□□ 1,61
ToporslQ9D2F8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,09■■□□□ 1,61
ToporslQ9D2F8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
ToporslQ9D2F8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
ToporslQ9D2F8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
ToporslQ9D2F8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25,06■■□□□ 1,6
ToporslQ9D2F8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
ToporslQ9D2F8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
ToporslQ9D2F8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
ToporslQ9D2F8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
ToporslQ9D2F8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
ToporslQ9D2F8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
ToporslQ9D2F8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
ToporslQ9D2F8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
ToporslQ9D2F8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
ToporslQ9D2F8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
ToporslQ9D2F8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
ToporslQ9D2F8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
ToporslQ9D2F8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
ToporslQ9D2F8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
ToporslQ9D2F8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32,1 ms