Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E6

Tbcb, Tubulin-folding cofactor B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcbQ9D1E6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TbcbQ9D1E6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TbcbQ9D1E6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TbcbQ9D1E6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TbcbQ9D1E6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TbcbQ9D1E6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TbcbQ9D1E6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TbcbQ9D1E6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TbcbQ9D1E6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TbcbQ9D1E6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TbcbQ9D1E6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TbcbQ9D1E6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TbcbQ9D1E6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TbcbQ9D1E6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TbcbQ9D1E6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TbcbQ9D1E6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TbcbQ9D1E6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TbcbQ9D1E6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TbcbQ9D1E6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TbcbQ9D1E6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TbcbQ9D1E6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TbcbQ9D1E6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TbcbQ9D1E6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TbcbQ9D1E6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TbcbQ9D1E6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TbcbQ9D1E6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TbcbQ9D1E6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TbcbQ9D1E6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TbcbQ9D1E6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TbcbQ9D1E6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TbcbQ9D1E6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TbcbQ9D1E6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TbcbQ9D1E6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TbcbQ9D1E6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TbcbQ9D1E6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TbcbQ9D1E6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TbcbQ9D1E6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TbcbQ9D1E6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TbcbQ9D1E6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TbcbQ9D1E6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TbcbQ9D1E6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TbcbQ9D1E6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TbcbQ9D1E6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TbcbQ9D1E6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TbcbQ9D1E6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TbcbQ9D1E6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TbcbQ9D1E6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TbcbQ9D1E6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TbcbQ9D1E6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TbcbQ9D1E6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TbcbQ9D1E6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TbcbQ9D1E6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TbcbQ9D1E6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TbcbQ9D1E6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TbcbQ9D1E6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TbcbQ9D1E6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TbcbQ9D1E6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TbcbQ9D1E6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TbcbQ9D1E6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TbcbQ9D1E6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TbcbQ9D1E6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TbcbQ9D1E6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TbcbQ9D1E6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TbcbQ9D1E6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TbcbQ9D1E6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TbcbQ9D1E6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TbcbQ9D1E6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TbcbQ9D1E6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TbcbQ9D1E6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TbcbQ9D1E6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TbcbQ9D1E6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TbcbQ9D1E6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TbcbQ9D1E6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TbcbQ9D1E6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TbcbQ9D1E6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TbcbQ9D1E6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TbcbQ9D1E6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TbcbQ9D1E6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TbcbQ9D1E6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TbcbQ9D1E6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TbcbQ9D1E6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TbcbQ9D1E6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TbcbQ9D1E6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TbcbQ9D1E6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TbcbQ9D1E6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TbcbQ9D1E6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TbcbQ9D1E6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TbcbQ9D1E6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TbcbQ9D1E6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TbcbQ9D1E6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TbcbQ9D1E6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TbcbQ9D1E6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TbcbQ9D1E6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TbcbQ9D1E6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TbcbQ9D1E6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TbcbQ9D1E6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TbcbQ9D1E6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
TbcbQ9D1E6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TbcbQ9D1E6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TbcbQ9D1E6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms