Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Upk1aQ9D132 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upk1aQ9D132 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upk1aQ9D132 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upk1aQ9D132 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Upk1aQ9D132 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Upk1aQ9D132 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Upk1aQ9D132 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Upk1aQ9D132 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Upk1aQ9D132 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Upk1aQ9D132 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Upk1aQ9D132 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Upk1aQ9D132 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Upk1aQ9D132 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Upk1aQ9D132 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Upk1aQ9D132 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Upk1aQ9D132 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upk1aQ9D132 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upk1aQ9D132 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upk1aQ9D132 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upk1aQ9D132 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upk1aQ9D132 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Upk1aQ9D132 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upk1aQ9D132 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upk1aQ9D132 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upk1aQ9D132 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Upk1aQ9D132 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upk1aQ9D132 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upk1aQ9D132 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upk1aQ9D132 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upk1aQ9D132 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upk1aQ9D132 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upk1aQ9D132 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upk1aQ9D132 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upk1aQ9D132 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upk1aQ9D132 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upk1aQ9D132 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Upk1aQ9D132 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Upk1aQ9D132 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Upk1aQ9D132 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upk1aQ9D132 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upk1aQ9D132 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upk1aQ9D132 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upk1aQ9D132 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upk1aQ9D132 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upk1aQ9D132 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Upk1aQ9D132 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upk1aQ9D132 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upk1aQ9D132 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upk1aQ9D132 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upk1aQ9D132 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upk1aQ9D132 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upk1aQ9D132 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Upk1aQ9D132 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Upk1aQ9D132 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upk1aQ9D132 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upk1aQ9D132 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upk1aQ9D132 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upk1aQ9D132 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upk1aQ9D132 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upk1aQ9D132 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upk1aQ9D132 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upk1aQ9D132 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upk1aQ9D132 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upk1aQ9D132 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upk1aQ9D132 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upk1aQ9D132 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upk1aQ9D132 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upk1aQ9D132 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upk1aQ9D132 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upk1aQ9D132 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upk1aQ9D132 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upk1aQ9D132 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upk1aQ9D132 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upk1aQ9D132 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Upk1aQ9D132 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upk1aQ9D132 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upk1aQ9D132 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upk1aQ9D132 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Upk1aQ9D132 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upk1aQ9D132 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upk1aQ9D132 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upk1aQ9D132 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upk1aQ9D132 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upk1aQ9D132 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upk1aQ9D132 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upk1aQ9D132 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upk1aQ9D132 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upk1aQ9D132 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upk1aQ9D132 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upk1aQ9D132 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upk1aQ9D132 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upk1aQ9D132 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Upk1aQ9D132 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upk1aQ9D132 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Upk1aQ9D132 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Upk1aQ9D132 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Upk1aQ9D132 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Upk1aQ9D132 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Upk1aQ9D132 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms