Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab3bQ9CZT8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab3bQ9CZT8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab3bQ9CZT8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab3bQ9CZT8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab3bQ9CZT8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rab3bQ9CZT8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rab3bQ9CZT8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rab3bQ9CZT8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rab3bQ9CZT8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab3bQ9CZT8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab3bQ9CZT8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab3bQ9CZT8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab3bQ9CZT8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab3bQ9CZT8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab3bQ9CZT8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab3bQ9CZT8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab3bQ9CZT8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab3bQ9CZT8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab3bQ9CZT8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab3bQ9CZT8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab3bQ9CZT8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab3bQ9CZT8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab3bQ9CZT8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab3bQ9CZT8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab3bQ9CZT8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab3bQ9CZT8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab3bQ9CZT8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab3bQ9CZT8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab3bQ9CZT8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab3bQ9CZT8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab3bQ9CZT8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab3bQ9CZT8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab3bQ9CZT8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab3bQ9CZT8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab3bQ9CZT8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab3bQ9CZT8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab3bQ9CZT8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab3bQ9CZT8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab3bQ9CZT8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab3bQ9CZT8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab3bQ9CZT8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab3bQ9CZT8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab3bQ9CZT8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab3bQ9CZT8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rab3bQ9CZT8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab3bQ9CZT8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab3bQ9CZT8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab3bQ9CZT8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab3bQ9CZT8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab3bQ9CZT8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab3bQ9CZT8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab3bQ9CZT8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab3bQ9CZT8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab3bQ9CZT8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab3bQ9CZT8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab3bQ9CZT8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab3bQ9CZT8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab3bQ9CZT8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab3bQ9CZT8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab3bQ9CZT8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab3bQ9CZT8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab3bQ9CZT8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab3bQ9CZT8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab3bQ9CZT8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab3bQ9CZT8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rab3bQ9CZT8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rab3bQ9CZT8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab3bQ9CZT8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab3bQ9CZT8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab3bQ9CZT8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab3bQ9CZT8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab3bQ9CZT8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab3bQ9CZT8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab3bQ9CZT8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab3bQ9CZT8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab3bQ9CZT8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab3bQ9CZT8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab3bQ9CZT8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab3bQ9CZT8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab3bQ9CZT8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab3bQ9CZT8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab3bQ9CZT8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab3bQ9CZT8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab3bQ9CZT8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab3bQ9CZT8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab3bQ9CZT8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab3bQ9CZT8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab3bQ9CZT8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab3bQ9CZT8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab3bQ9CZT8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab3bQ9CZT8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab3bQ9CZT8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab3bQ9CZT8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab3bQ9CZT8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab3bQ9CZT8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab3bQ9CZT8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab3bQ9CZT8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab3bQ9CZT8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab3bQ9CZT8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms