Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prelid3bQ9CYY7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prelid3bQ9CYY7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prelid3bQ9CYY7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prelid3bQ9CYY7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prelid3bQ9CYY7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prelid3bQ9CYY7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prelid3bQ9CYY7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prelid3bQ9CYY7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prelid3bQ9CYY7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prelid3bQ9CYY7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prelid3bQ9CYY7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prelid3bQ9CYY7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prelid3bQ9CYY7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prelid3bQ9CYY7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prelid3bQ9CYY7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prelid3bQ9CYY7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prelid3bQ9CYY7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prelid3bQ9CYY7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prelid3bQ9CYY7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prelid3bQ9CYY7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prelid3bQ9CYY7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prelid3bQ9CYY7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prelid3bQ9CYY7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prelid3bQ9CYY7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prelid3bQ9CYY7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prelid3bQ9CYY7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prelid3bQ9CYY7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prelid3bQ9CYY7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prelid3bQ9CYY7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prelid3bQ9CYY7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prelid3bQ9CYY7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prelid3bQ9CYY7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prelid3bQ9CYY7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prelid3bQ9CYY7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prelid3bQ9CYY7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prelid3bQ9CYY7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prelid3bQ9CYY7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prelid3bQ9CYY7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prelid3bQ9CYY7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prelid3bQ9CYY7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prelid3bQ9CYY7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prelid3bQ9CYY7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Prelid3bQ9CYY7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prelid3bQ9CYY7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prelid3bQ9CYY7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prelid3bQ9CYY7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prelid3bQ9CYY7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prelid3bQ9CYY7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prelid3bQ9CYY7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prelid3bQ9CYY7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prelid3bQ9CYY7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prelid3bQ9CYY7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prelid3bQ9CYY7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prelid3bQ9CYY7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prelid3bQ9CYY7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prelid3bQ9CYY7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prelid3bQ9CYY7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prelid3bQ9CYY7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prelid3bQ9CYY7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prelid3bQ9CYY7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prelid3bQ9CYY7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prelid3bQ9CYY7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prelid3bQ9CYY7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prelid3bQ9CYY7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prelid3bQ9CYY7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prelid3bQ9CYY7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prelid3bQ9CYY7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prelid3bQ9CYY7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prelid3bQ9CYY7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prelid3bQ9CYY7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prelid3bQ9CYY7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prelid3bQ9CYY7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prelid3bQ9CYY7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prelid3bQ9CYY7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prelid3bQ9CYY7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prelid3bQ9CYY7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prelid3bQ9CYY7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prelid3bQ9CYY7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prelid3bQ9CYY7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prelid3bQ9CYY7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prelid3bQ9CYY7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prelid3bQ9CYY7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prelid3bQ9CYY7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Prelid3bQ9CYY7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prelid3bQ9CYY7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prelid3bQ9CYY7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prelid3bQ9CYY7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prelid3bQ9CYY7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prelid3bQ9CYY7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prelid3bQ9CYY7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prelid3bQ9CYY7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prelid3bQ9CYY7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prelid3bQ9CYY7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prelid3bQ9CYY7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prelid3bQ9CYY7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prelid3bQ9CYY7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prelid3bQ9CYY7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Prelid3bQ9CYY7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prelid3bQ9CYY7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms