Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tmem39aQ9CYC3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tmem39aQ9CYC3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tmem39aQ9CYC3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tmem39aQ9CYC3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmem39aQ9CYC3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmem39aQ9CYC3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmem39aQ9CYC3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tmem39aQ9CYC3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tmem39aQ9CYC3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tmem39aQ9CYC3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tmem39aQ9CYC3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tmem39aQ9CYC3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tmem39aQ9CYC3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tmem39aQ9CYC3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tmem39aQ9CYC3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tmem39aQ9CYC3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tmem39aQ9CYC3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Tmem39aQ9CYC3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tmem39aQ9CYC3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tmem39aQ9CYC3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tmem39aQ9CYC3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tmem39aQ9CYC3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tmem39aQ9CYC3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tmem39aQ9CYC3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tmem39aQ9CYC3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tmem39aQ9CYC3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tmem39aQ9CYC3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tmem39aQ9CYC3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tmem39aQ9CYC3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tmem39aQ9CYC3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tmem39aQ9CYC3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tmem39aQ9CYC3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tmem39aQ9CYC3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tmem39aQ9CYC3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Tmem39aQ9CYC3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tmem39aQ9CYC3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tmem39aQ9CYC3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tmem39aQ9CYC3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tmem39aQ9CYC3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tmem39aQ9CYC3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmem39aQ9CYC3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmem39aQ9CYC3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tmem39aQ9CYC3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tmem39aQ9CYC3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tmem39aQ9CYC3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tmem39aQ9CYC3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tmem39aQ9CYC3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tmem39aQ9CYC3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tmem39aQ9CYC3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmem39aQ9CYC3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmem39aQ9CYC3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmem39aQ9CYC3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmem39aQ9CYC3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmem39aQ9CYC3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Tmem39aQ9CYC3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tmem39aQ9CYC3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tmem39aQ9CYC3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tmem39aQ9CYC3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tmem39aQ9CYC3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tmem39aQ9CYC3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tmem39aQ9CYC3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tmem39aQ9CYC3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tmem39aQ9CYC3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tmem39aQ9CYC3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tmem39aQ9CYC3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tmem39aQ9CYC3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tmem39aQ9CYC3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tmem39aQ9CYC3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tmem39aQ9CYC3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tmem39aQ9CYC3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tmem39aQ9CYC3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tmem39aQ9CYC3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tmem39aQ9CYC3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Tmem39aQ9CYC3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tmem39aQ9CYC3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tmem39aQ9CYC3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tmem39aQ9CYC3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tmem39aQ9CYC3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tmem39aQ9CYC3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tmem39aQ9CYC3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tmem39aQ9CYC3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tmem39aQ9CYC3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tmem39aQ9CYC3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tmem39aQ9CYC3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tmem39aQ9CYC3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Tmem39aQ9CYC3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tmem39aQ9CYC3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tmem39aQ9CYC3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tmem39aQ9CYC3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tmem39aQ9CYC3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tmem39aQ9CYC3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tmem39aQ9CYC3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tmem39aQ9CYC3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tmem39aQ9CYC3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tmem39aQ9CYC3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Tmem39aQ9CYC3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tmem39aQ9CYC3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tmem39aQ9CYC3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tmem39aQ9CYC3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 280 ms