Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube2fQ9CY34 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube2fQ9CY34 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube2fQ9CY34 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2fQ9CY34 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2fQ9CY34 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2fQ9CY34 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube2fQ9CY34 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube2fQ9CY34 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube2fQ9CY34 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube2fQ9CY34 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube2fQ9CY34 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube2fQ9CY34 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube2fQ9CY34 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube2fQ9CY34 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube2fQ9CY34 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube2fQ9CY34 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube2fQ9CY34 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube2fQ9CY34 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube2fQ9CY34 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube2fQ9CY34 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube2fQ9CY34 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube2fQ9CY34 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2fQ9CY34 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2fQ9CY34 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube2fQ9CY34 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube2fQ9CY34 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube2fQ9CY34 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube2fQ9CY34 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube2fQ9CY34 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube2fQ9CY34 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube2fQ9CY34 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube2fQ9CY34 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2fQ9CY34 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2fQ9CY34 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2fQ9CY34 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2fQ9CY34 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2fQ9CY34 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2fQ9CY34 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube2fQ9CY34 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube2fQ9CY34 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube2fQ9CY34 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube2fQ9CY34 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube2fQ9CY34 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube2fQ9CY34 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube2fQ9CY34 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube2fQ9CY34 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube2fQ9CY34 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube2fQ9CY34 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube2fQ9CY34 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube2fQ9CY34 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube2fQ9CY34 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube2fQ9CY34 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube2fQ9CY34 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube2fQ9CY34 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube2fQ9CY34 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube2fQ9CY34 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube2fQ9CY34 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube2fQ9CY34 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube2fQ9CY34 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube2fQ9CY34 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube2fQ9CY34 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube2fQ9CY34 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube2fQ9CY34 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ube2fQ9CY34 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2fQ9CY34 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2fQ9CY34 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2fQ9CY34 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube2fQ9CY34 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube2fQ9CY34 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube2fQ9CY34 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube2fQ9CY34 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube2fQ9CY34 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2fQ9CY34 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2fQ9CY34 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube2fQ9CY34 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2fQ9CY34 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2fQ9CY34 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2fQ9CY34 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2fQ9CY34 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2fQ9CY34 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2fQ9CY34 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2fQ9CY34 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2fQ9CY34 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2fQ9CY34 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2fQ9CY34 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2fQ9CY34 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2fQ9CY34 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2fQ9CY34 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2fQ9CY34 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2fQ9CY34 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2fQ9CY34 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2fQ9CY34 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2fQ9CY34 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2fQ9CY34 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2fQ9CY34 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2fQ9CY34 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2fQ9CY34 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2fQ9CY34 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2fQ9CY34 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.2 ms