Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtpbp8Q9CY28 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp8Q9CY28 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp8Q9CY28 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp8Q9CY28 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtpbp8Q9CY28 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp8Q9CY28 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp8Q9CY28 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtpbp8Q9CY28 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtpbp8Q9CY28 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtpbp8Q9CY28 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtpbp8Q9CY28 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtpbp8Q9CY28 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp8Q9CY28 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp8Q9CY28 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtpbp8Q9CY28 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtpbp8Q9CY28 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtpbp8Q9CY28 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtpbp8Q9CY28 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtpbp8Q9CY28 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp8Q9CY28 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp8Q9CY28 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp8Q9CY28 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp8Q9CY28 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtpbp8Q9CY28 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtpbp8Q9CY28 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp8Q9CY28 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp8Q9CY28 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp8Q9CY28 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp8Q9CY28 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp8Q9CY28 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp8Q9CY28 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp8Q9CY28 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp8Q9CY28 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp8Q9CY28 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp8Q9CY28 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp8Q9CY28 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp8Q9CY28 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp8Q9CY28 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp8Q9CY28 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp8Q9CY28 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp8Q9CY28 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp8Q9CY28 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp8Q9CY28 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp8Q9CY28 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp8Q9CY28 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp8Q9CY28 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp8Q9CY28 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp8Q9CY28 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp8Q9CY28 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp8Q9CY28 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp8Q9CY28 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp8Q9CY28 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gtpbp8Q9CY28 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp8Q9CY28 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp8Q9CY28 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp8Q9CY28 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp8Q9CY28 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp8Q9CY28 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp8Q9CY28 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp8Q9CY28 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp8Q9CY28 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp8Q9CY28 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp8Q9CY28 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp8Q9CY28 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp8Q9CY28 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp8Q9CY28 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp8Q9CY28 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp8Q9CY28 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp8Q9CY28 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp8Q9CY28 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp8Q9CY28 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtpbp8Q9CY28 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtpbp8Q9CY28 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp8Q9CY28 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp8Q9CY28 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp8Q9CY28 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp8Q9CY28 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp8Q9CY28 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp8Q9CY28 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp8Q9CY28 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp8Q9CY28 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp8Q9CY28 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp8Q9CY28 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp8Q9CY28 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtpbp8Q9CY28 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtpbp8Q9CY28 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtpbp8Q9CY28 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtpbp8Q9CY28 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp8Q9CY28 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtpbp8Q9CY28 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtpbp8Q9CY28 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtpbp8Q9CY28 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtpbp8Q9CY28 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtpbp8Q9CY28 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtpbp8Q9CY28 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtpbp8Q9CY28 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp8Q9CY28 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp8Q9CY28 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp8Q9CY28 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms