Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ndufb9Q9CQJ8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ndufb9Q9CQJ8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ndufb9Q9CQJ8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ndufb9Q9CQJ8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ndufb9Q9CQJ8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ndufb9Q9CQJ8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ndufb9Q9CQJ8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ndufb9Q9CQJ8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ndufb9Q9CQJ8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ndufb9Q9CQJ8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ndufb9Q9CQJ8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ndufb9Q9CQJ8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ndufb9Q9CQJ8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ndufb9Q9CQJ8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ndufb9Q9CQJ8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ndufb9Q9CQJ8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ndufb9Q9CQJ8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ndufb9Q9CQJ8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ndufb9Q9CQJ8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ndufb9Q9CQJ8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ndufb9Q9CQJ8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ndufb9Q9CQJ8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ndufb9Q9CQJ8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ndufb9Q9CQJ8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ndufb9Q9CQJ8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ndufb9Q9CQJ8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ndufb9Q9CQJ8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ndufb9Q9CQJ8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ndufb9Q9CQJ8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ndufb9Q9CQJ8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ndufb9Q9CQJ8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ndufb9Q9CQJ8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ndufb9Q9CQJ8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ndufb9Q9CQJ8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ndufb9Q9CQJ8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ndufb9Q9CQJ8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ndufb9Q9CQJ8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ndufb9Q9CQJ8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ndufb9Q9CQJ8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ndufb9Q9CQJ8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ndufb9Q9CQJ8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ndufb9Q9CQJ8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ndufb9Q9CQJ8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ndufb9Q9CQJ8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ndufb9Q9CQJ8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ndufb9Q9CQJ8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ndufb9Q9CQJ8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ndufb9Q9CQJ8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ndufb9Q9CQJ8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ndufb9Q9CQJ8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ndufb9Q9CQJ8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ndufb9Q9CQJ8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ndufb9Q9CQJ8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ndufb9Q9CQJ8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ndufb9Q9CQJ8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ndufb9Q9CQJ8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ndufb9Q9CQJ8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ndufb9Q9CQJ8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ndufb9Q9CQJ8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ndufb9Q9CQJ8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ndufb9Q9CQJ8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ndufb9Q9CQJ8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ndufb9Q9CQJ8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ndufb9Q9CQJ8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ndufb9Q9CQJ8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ndufb9Q9CQJ8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ndufb9Q9CQJ8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ndufb9Q9CQJ8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ndufb9Q9CQJ8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ndufb9Q9CQJ8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ndufb9Q9CQJ8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ndufb9Q9CQJ8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ndufb9Q9CQJ8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ndufb9Q9CQJ8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ndufb9Q9CQJ8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ndufb9Q9CQJ8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ndufb9Q9CQJ8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ndufb9Q9CQJ8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ndufb9Q9CQJ8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms