Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed6Q9CQG0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed6Q9CQG0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed6Q9CQG0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed6Q9CQG0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed6Q9CQG0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed6Q9CQG0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed6Q9CQG0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed6Q9CQG0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed6Q9CQG0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed6Q9CQG0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed6Q9CQG0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed6Q9CQG0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed6Q9CQG0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed6Q9CQG0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed6Q9CQG0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed6Q9CQG0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed6Q9CQG0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed6Q9CQG0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed6Q9CQG0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed6Q9CQG0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed6Q9CQG0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed6Q9CQG0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed6Q9CQG0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed6Q9CQG0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed6Q9CQG0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed6Q9CQG0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed6Q9CQG0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed6Q9CQG0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed6Q9CQG0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed6Q9CQG0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed6Q9CQG0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed6Q9CQG0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed6Q9CQG0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed6Q9CQG0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed6Q9CQG0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed6Q9CQG0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed6Q9CQG0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed6Q9CQG0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed6Q9CQG0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed6Q9CQG0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed6Q9CQG0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed6Q9CQG0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed6Q9CQG0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed6Q9CQG0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed6Q9CQG0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed6Q9CQG0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed6Q9CQG0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed6Q9CQG0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed6Q9CQG0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed6Q9CQG0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed6Q9CQG0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed6Q9CQG0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed6Q9CQG0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed6Q9CQG0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed6Q9CQG0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed6Q9CQG0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed6Q9CQG0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed6Q9CQG0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed6Q9CQG0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed6Q9CQG0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed6Q9CQG0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed6Q9CQG0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed6Q9CQG0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed6Q9CQG0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed6Q9CQG0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed6Q9CQG0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed6Q9CQG0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed6Q9CQG0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed6Q9CQG0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed6Q9CQG0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed6Q9CQG0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms