Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc5Q9CQA1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc5Q9CQA1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc5Q9CQA1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc5Q9CQA1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc5Q9CQA1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc5Q9CQA1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc5Q9CQA1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc5Q9CQA1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc5Q9CQA1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc5Q9CQA1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc5Q9CQA1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc5Q9CQA1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc5Q9CQA1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc5Q9CQA1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc5Q9CQA1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc5Q9CQA1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc5Q9CQA1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc5Q9CQA1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc5Q9CQA1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trappc5Q9CQA1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trappc5Q9CQA1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trappc5Q9CQA1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc5Q9CQA1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc5Q9CQA1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc5Q9CQA1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc5Q9CQA1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc5Q9CQA1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc5Q9CQA1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc5Q9CQA1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc5Q9CQA1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc5Q9CQA1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc5Q9CQA1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc5Q9CQA1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc5Q9CQA1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc5Q9CQA1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc5Q9CQA1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc5Q9CQA1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc5Q9CQA1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc5Q9CQA1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc5Q9CQA1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc5Q9CQA1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc5Q9CQA1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc5Q9CQA1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc5Q9CQA1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc5Q9CQA1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc5Q9CQA1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc5Q9CQA1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc5Q9CQA1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc5Q9CQA1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc5Q9CQA1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc5Q9CQA1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc5Q9CQA1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc5Q9CQA1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc5Q9CQA1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc5Q9CQA1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc5Q9CQA1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc5Q9CQA1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc5Q9CQA1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc5Q9CQA1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc5Q9CQA1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc5Q9CQA1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc5Q9CQA1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc5Q9CQA1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc5Q9CQA1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc5Q9CQA1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc5Q9CQA1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc5Q9CQA1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc5Q9CQA1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc5Q9CQA1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc5Q9CQA1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc5Q9CQA1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc5Q9CQA1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc5Q9CQA1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trappc5Q9CQA1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc5Q9CQA1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc5Q9CQA1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc5Q9CQA1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc5Q9CQA1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc5Q9CQA1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc5Q9CQA1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc5Q9CQA1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc5Q9CQA1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc5Q9CQA1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc5Q9CQA1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc5Q9CQA1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc5Q9CQA1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc5Q9CQA1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc5Q9CQA1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc5Q9CQA1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc5Q9CQA1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc5Q9CQA1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc5Q9CQA1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc5Q9CQA1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc5Q9CQA1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc5Q9CQA1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc5Q9CQA1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc5Q9CQA1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc5Q9CQA1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc5Q9CQA1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms