Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pkp2Q9CQ73 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Pkp2Q9CQ73 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pkp2Q9CQ73 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pkp2Q9CQ73 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pkp2Q9CQ73 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pkp2Q9CQ73 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pkp2Q9CQ73 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pkp2Q9CQ73 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pkp2Q9CQ73 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pkp2Q9CQ73 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pkp2Q9CQ73 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pkp2Q9CQ73 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pkp2Q9CQ73 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pkp2Q9CQ73 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pkp2Q9CQ73 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Pkp2Q9CQ73 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Pkp2Q9CQ73 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pkp2Q9CQ73 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pkp2Q9CQ73 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pkp2Q9CQ73 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pkp2Q9CQ73 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pkp2Q9CQ73 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pkp2Q9CQ73 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pkp2Q9CQ73 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pkp2Q9CQ73 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pkp2Q9CQ73 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pkp2Q9CQ73 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pkp2Q9CQ73 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Pkp2Q9CQ73 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pkp2Q9CQ73 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pkp2Q9CQ73 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pkp2Q9CQ73 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pkp2Q9CQ73 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pkp2Q9CQ73 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pkp2Q9CQ73 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pkp2Q9CQ73 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pkp2Q9CQ73 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pkp2Q9CQ73 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pkp2Q9CQ73 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pkp2Q9CQ73 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pkp2Q9CQ73 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pkp2Q9CQ73 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Pkp2Q9CQ73 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pkp2Q9CQ73 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pkp2Q9CQ73 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pkp2Q9CQ73 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pkp2Q9CQ73 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pkp2Q9CQ73 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pkp2Q9CQ73 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pkp2Q9CQ73 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pkp2Q9CQ73 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pkp2Q9CQ73 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pkp2Q9CQ73 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pkp2Q9CQ73 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pkp2Q9CQ73 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pkp2Q9CQ73 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pkp2Q9CQ73 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pkp2Q9CQ73 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pkp2Q9CQ73 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pkp2Q9CQ73 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pkp2Q9CQ73 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pkp2Q9CQ73 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pkp2Q9CQ73 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pkp2Q9CQ73 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pkp2Q9CQ73 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pkp2Q9CQ73 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pkp2Q9CQ73 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pkp2Q9CQ73 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pkp2Q9CQ73 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pkp2Q9CQ73 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pkp2Q9CQ73 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pkp2Q9CQ73 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pkp2Q9CQ73 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pkp2Q9CQ73 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pkp2Q9CQ73 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pkp2Q9CQ73 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Pkp2Q9CQ73 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pkp2Q9CQ73 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Pkp2Q9CQ73 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pkp2Q9CQ73 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pkp2Q9CQ73 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pkp2Q9CQ73 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pkp2Q9CQ73 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pkp2Q9CQ73 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pkp2Q9CQ73 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pkp2Q9CQ73 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pkp2Q9CQ73 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pkp2Q9CQ73 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pkp2Q9CQ73 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pkp2Q9CQ73 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pkp2Q9CQ73 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pkp2Q9CQ73 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pkp2Q9CQ73 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pkp2Q9CQ73 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Pkp2Q9CQ73 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pkp2Q9CQ73 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pkp2Q9CQ73 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pkp2Q9CQ73 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pkp2Q9CQ73 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms