Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI8

Rtn4r, Reticulon-4 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rQ99PI8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rtn4rQ99PI8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rtn4rQ99PI8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rtn4rQ99PI8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rtn4rQ99PI8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rtn4rQ99PI8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtn4rQ99PI8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtn4rQ99PI8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtn4rQ99PI8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtn4rQ99PI8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtn4rQ99PI8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtn4rQ99PI8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtn4rQ99PI8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtn4rQ99PI8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtn4rQ99PI8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtn4rQ99PI8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtn4rQ99PI8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtn4rQ99PI8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtn4rQ99PI8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtn4rQ99PI8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtn4rQ99PI8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtn4rQ99PI8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtn4rQ99PI8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtn4rQ99PI8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtn4rQ99PI8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtn4rQ99PI8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtn4rQ99PI8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtn4rQ99PI8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtn4rQ99PI8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtn4rQ99PI8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtn4rQ99PI8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtn4rQ99PI8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rtn4rQ99PI8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rtn4rQ99PI8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtn4rQ99PI8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtn4rQ99PI8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtn4rQ99PI8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtn4rQ99PI8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtn4rQ99PI8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtn4rQ99PI8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtn4rQ99PI8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtn4rQ99PI8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtn4rQ99PI8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtn4rQ99PI8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtn4rQ99PI8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtn4rQ99PI8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtn4rQ99PI8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtn4rQ99PI8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtn4rQ99PI8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtn4rQ99PI8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtn4rQ99PI8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtn4rQ99PI8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtn4rQ99PI8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtn4rQ99PI8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtn4rQ99PI8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtn4rQ99PI8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtn4rQ99PI8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtn4rQ99PI8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtn4rQ99PI8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rtn4rQ99PI8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtn4rQ99PI8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rtn4rQ99PI8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtn4rQ99PI8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtn4rQ99PI8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rtn4rQ99PI8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtn4rQ99PI8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtn4rQ99PI8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtn4rQ99PI8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtn4rQ99PI8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtn4rQ99PI8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtn4rQ99PI8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtn4rQ99PI8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtn4rQ99PI8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtn4rQ99PI8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rtn4rQ99PI8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtn4rQ99PI8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtn4rQ99PI8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtn4rQ99PI8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtn4rQ99PI8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtn4rQ99PI8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtn4rQ99PI8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtn4rQ99PI8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtn4rQ99PI8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtn4rQ99PI8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtn4rQ99PI8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtn4rQ99PI8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtn4rQ99PI8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtn4rQ99PI8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtn4rQ99PI8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtn4rQ99PI8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtn4rQ99PI8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtn4rQ99PI8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtn4rQ99PI8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtn4rQ99PI8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtn4rQ99PI8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtn4rQ99PI8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rtn4rQ99PI8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rtn4rQ99PI8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rtn4rQ99PI8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rtn4rQ99PI8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms