Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rims1Q99NE5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Rims1Q99NE5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Rims1Q99NE5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rims1Q99NE5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rims1Q99NE5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rims1Q99NE5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rims1Q99NE5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rims1Q99NE5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rims1Q99NE5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rims1Q99NE5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rims1Q99NE5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rims1Q99NE5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rims1Q99NE5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Rims1Q99NE5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rims1Q99NE5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rims1Q99NE5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Rims1Q99NE5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rims1Q99NE5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rims1Q99NE5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rims1Q99NE5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rims1Q99NE5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rims1Q99NE5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Rims1Q99NE5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rims1Q99NE5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rims1Q99NE5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rims1Q99NE5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rims1Q99NE5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rims1Q99NE5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rims1Q99NE5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Rims1Q99NE5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Rims1Q99NE5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rims1Q99NE5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rims1Q99NE5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rims1Q99NE5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rims1Q99NE5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Rims1Q99NE5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rims1Q99NE5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rims1Q99NE5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rims1Q99NE5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rims1Q99NE5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rims1Q99NE5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rims1Q99NE5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rims1Q99NE5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rims1Q99NE5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rims1Q99NE5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rims1Q99NE5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rims1Q99NE5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Rims1Q99NE5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rims1Q99NE5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rims1Q99NE5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rims1Q99NE5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rims1Q99NE5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rims1Q99NE5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rims1Q99NE5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rims1Q99NE5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rims1Q99NE5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rims1Q99NE5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rims1Q99NE5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rims1Q99NE5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rims1Q99NE5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rims1Q99NE5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rims1Q99NE5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rims1Q99NE5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rims1Q99NE5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rims1Q99NE5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rims1Q99NE5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rims1Q99NE5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rims1Q99NE5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rims1Q99NE5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rims1Q99NE5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rims1Q99NE5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Rims1Q99NE5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rims1Q99NE5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rims1Q99NE5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rims1Q99NE5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rims1Q99NE5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rims1Q99NE5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rims1Q99NE5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rims1Q99NE5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rims1Q99NE5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rims1Q99NE5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rims1Q99NE5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rims1Q99NE5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Rims1Q99NE5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Rims1Q99NE5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Rims1Q99NE5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rims1Q99NE5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rims1Q99NE5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rims1Q99NE5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rims1Q99NE5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rims1Q99NE5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rims1Q99NE5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rims1Q99NE5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rims1Q99NE5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rims1Q99NE5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rims1Q99NE5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rims1Q99NE5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rims1Q99NE5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rims1Q99NE5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms