Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nus1Q99LJ8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nus1Q99LJ8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nus1Q99LJ8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nus1Q99LJ8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nus1Q99LJ8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nus1Q99LJ8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nus1Q99LJ8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nus1Q99LJ8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nus1Q99LJ8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nus1Q99LJ8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nus1Q99LJ8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nus1Q99LJ8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nus1Q99LJ8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nus1Q99LJ8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nus1Q99LJ8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nus1Q99LJ8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nus1Q99LJ8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nus1Q99LJ8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nus1Q99LJ8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nus1Q99LJ8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nus1Q99LJ8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nus1Q99LJ8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nus1Q99LJ8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nus1Q99LJ8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nus1Q99LJ8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nus1Q99LJ8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nus1Q99LJ8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nus1Q99LJ8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nus1Q99LJ8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nus1Q99LJ8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nus1Q99LJ8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nus1Q99LJ8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nus1Q99LJ8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nus1Q99LJ8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nus1Q99LJ8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nus1Q99LJ8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nus1Q99LJ8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nus1Q99LJ8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nus1Q99LJ8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nus1Q99LJ8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nus1Q99LJ8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nus1Q99LJ8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nus1Q99LJ8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nus1Q99LJ8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nus1Q99LJ8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nus1Q99LJ8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nus1Q99LJ8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nus1Q99LJ8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nus1Q99LJ8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nus1Q99LJ8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nus1Q99LJ8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nus1Q99LJ8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nus1Q99LJ8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nus1Q99LJ8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nus1Q99LJ8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nus1Q99LJ8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nus1Q99LJ8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nus1Q99LJ8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nus1Q99LJ8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nus1Q99LJ8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nus1Q99LJ8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nus1Q99LJ8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nus1Q99LJ8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nus1Q99LJ8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nus1Q99LJ8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nus1Q99LJ8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nus1Q99LJ8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nus1Q99LJ8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nus1Q99LJ8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nus1Q99LJ8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nus1Q99LJ8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms