Protein–RNA interactions for Protein: Q99L13

Hibadh, 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HibadhQ99L13 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HibadhQ99L13 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HibadhQ99L13 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HibadhQ99L13 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HibadhQ99L13 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
HibadhQ99L13 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HibadhQ99L13 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HibadhQ99L13 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HibadhQ99L13 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HibadhQ99L13 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HibadhQ99L13 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HibadhQ99L13 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HibadhQ99L13 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HibadhQ99L13 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HibadhQ99L13 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HibadhQ99L13 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HibadhQ99L13 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
HibadhQ99L13 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HibadhQ99L13 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HibadhQ99L13 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HibadhQ99L13 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HibadhQ99L13 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HibadhQ99L13 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HibadhQ99L13 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HibadhQ99L13 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HibadhQ99L13 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HibadhQ99L13 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HibadhQ99L13 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HibadhQ99L13 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HibadhQ99L13 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HibadhQ99L13 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HibadhQ99L13 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HibadhQ99L13 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HibadhQ99L13 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HibadhQ99L13 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HibadhQ99L13 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HibadhQ99L13 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HibadhQ99L13 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HibadhQ99L13 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HibadhQ99L13 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HibadhQ99L13 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HibadhQ99L13 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HibadhQ99L13 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HibadhQ99L13 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HibadhQ99L13 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HibadhQ99L13 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HibadhQ99L13 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HibadhQ99L13 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HibadhQ99L13 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HibadhQ99L13 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
HibadhQ99L13 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HibadhQ99L13 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HibadhQ99L13 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
HibadhQ99L13 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HibadhQ99L13 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HibadhQ99L13 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HibadhQ99L13 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HibadhQ99L13 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HibadhQ99L13 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HibadhQ99L13 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HibadhQ99L13 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
HibadhQ99L13 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HibadhQ99L13 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HibadhQ99L13 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HibadhQ99L13 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HibadhQ99L13 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HibadhQ99L13 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HibadhQ99L13 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HibadhQ99L13 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HibadhQ99L13 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HibadhQ99L13 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HibadhQ99L13 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HibadhQ99L13 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HibadhQ99L13 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HibadhQ99L13 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HibadhQ99L13 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HibadhQ99L13 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HibadhQ99L13 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HibadhQ99L13 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HibadhQ99L13 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HibadhQ99L13 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HibadhQ99L13 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HibadhQ99L13 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HibadhQ99L13 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HibadhQ99L13 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
HibadhQ99L13 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HibadhQ99L13 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HibadhQ99L13 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HibadhQ99L13 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HibadhQ99L13 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HibadhQ99L13 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HibadhQ99L13 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HibadhQ99L13 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HibadhQ99L13 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HibadhQ99L13 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HibadhQ99L13 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HibadhQ99L13 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HibadhQ99L13 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HibadhQ99L13 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HibadhQ99L13 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms