Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q99KU6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q99KU6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q99KU6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q99KU6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q99KU6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q99KU6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q99KU6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q99KU6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q99KU6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q99KU6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q99KU6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q99KU6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q99KU6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q99KU6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q99KU6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q99KU6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q99KU6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q99KU6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q99KU6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q99KU6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q99KU6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q99KU6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q99KU6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q99KU6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q99KU6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q99KU6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q99KU6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q99KU6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q99KU6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q99KU6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q99KU6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q99KU6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Q99KU6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q99KU6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q99KU6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q99KU6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q99KU6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q99KU6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q99KU6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q99KU6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q99KU6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q99KU6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q99KU6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q99KU6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q99KU6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q99KU6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q99KU6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q99KU6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q99KU6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q99KU6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q99KU6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q99KU6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q99KU6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q99KU6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q99KU6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q99KU6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q99KU6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Q99KU6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q99KU6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q99KU6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q99KU6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q99KU6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q99KU6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q99KU6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q99KU6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q99KU6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q99KU6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q99KU6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q99KU6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Q99KU6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q99KU6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Q99KU6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q99KU6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q99KU6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q99KU6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q99KU6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q99KU6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q99KU6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q99KU6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Q99KU6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q99KU6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q99KU6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q99KU6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q99KU6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q99KU6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q99KU6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q99KU6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q99KU6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q99KU6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q99KU6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q99KU6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q99KU6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q99KU6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q99KU6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Q99KU6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q99KU6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q99KU6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q99KU6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q99KU6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms