Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hps4Q99KG7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hps4Q99KG7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hps4Q99KG7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hps4Q99KG7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hps4Q99KG7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hps4Q99KG7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hps4Q99KG7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hps4Q99KG7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Hps4Q99KG7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hps4Q99KG7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hps4Q99KG7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hps4Q99KG7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hps4Q99KG7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hps4Q99KG7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hps4Q99KG7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hps4Q99KG7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hps4Q99KG7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hps4Q99KG7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hps4Q99KG7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Hps4Q99KG7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hps4Q99KG7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hps4Q99KG7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hps4Q99KG7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hps4Q99KG7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hps4Q99KG7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hps4Q99KG7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hps4Q99KG7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hps4Q99KG7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hps4Q99KG7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hps4Q99KG7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hps4Q99KG7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hps4Q99KG7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hps4Q99KG7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hps4Q99KG7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hps4Q99KG7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hps4Q99KG7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hps4Q99KG7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Hps4Q99KG7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hps4Q99KG7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hps4Q99KG7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hps4Q99KG7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hps4Q99KG7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hps4Q99KG7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hps4Q99KG7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hps4Q99KG7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hps4Q99KG7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hps4Q99KG7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hps4Q99KG7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hps4Q99KG7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hps4Q99KG7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hps4Q99KG7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hps4Q99KG7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hps4Q99KG7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Hps4Q99KG7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hps4Q99KG7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Hps4Q99KG7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hps4Q99KG7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hps4Q99KG7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hps4Q99KG7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hps4Q99KG7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hps4Q99KG7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hps4Q99KG7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hps4Q99KG7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hps4Q99KG7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hps4Q99KG7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hps4Q99KG7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hps4Q99KG7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hps4Q99KG7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hps4Q99KG7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hps4Q99KG7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hps4Q99KG7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hps4Q99KG7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hps4Q99KG7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hps4Q99KG7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hps4Q99KG7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hps4Q99KG7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hps4Q99KG7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hps4Q99KG7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hps4Q99KG7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hps4Q99KG7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hps4Q99KG7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hps4Q99KG7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hps4Q99KG7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hps4Q99KG7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hps4Q99KG7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Hps4Q99KG7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hps4Q99KG7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hps4Q99KG7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hps4Q99KG7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hps4Q99KG7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hps4Q99KG7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Hps4Q99KG7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Hps4Q99KG7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hps4Q99KG7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hps4Q99KG7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hps4Q99KG7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hps4Q99KG7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hps4Q99KG7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hps4Q99KG7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms