Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmed9Q99KF1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmed9Q99KF1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmed9Q99KF1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmed9Q99KF1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmed9Q99KF1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmed9Q99KF1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmed9Q99KF1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmed9Q99KF1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmed9Q99KF1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed9Q99KF1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed9Q99KF1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed9Q99KF1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed9Q99KF1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed9Q99KF1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed9Q99KF1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmed9Q99KF1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmed9Q99KF1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmed9Q99KF1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmed9Q99KF1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmed9Q99KF1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed9Q99KF1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed9Q99KF1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmed9Q99KF1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed9Q99KF1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed9Q99KF1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmed9Q99KF1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmed9Q99KF1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmed9Q99KF1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed9Q99KF1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed9Q99KF1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed9Q99KF1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed9Q99KF1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed9Q99KF1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed9Q99KF1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed9Q99KF1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed9Q99KF1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed9Q99KF1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmed9Q99KF1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmed9Q99KF1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmed9Q99KF1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmed9Q99KF1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmed9Q99KF1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmed9Q99KF1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmed9Q99KF1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmed9Q99KF1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmed9Q99KF1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmed9Q99KF1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmed9Q99KF1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmed9Q99KF1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmed9Q99KF1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmed9Q99KF1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmed9Q99KF1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmed9Q99KF1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmed9Q99KF1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmed9Q99KF1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmed9Q99KF1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmed9Q99KF1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed9Q99KF1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed9Q99KF1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed9Q99KF1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmed9Q99KF1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmed9Q99KF1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmed9Q99KF1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmed9Q99KF1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmed9Q99KF1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmed9Q99KF1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed9Q99KF1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed9Q99KF1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed9Q99KF1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed9Q99KF1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed9Q99KF1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed9Q99KF1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed9Q99KF1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed9Q99KF1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed9Q99KF1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed9Q99KF1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed9Q99KF1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed9Q99KF1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed9Q99KF1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed9Q99KF1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed9Q99KF1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmed9Q99KF1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmed9Q99KF1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmed9Q99KF1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed9Q99KF1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed9Q99KF1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed9Q99KF1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed9Q99KF1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed9Q99KF1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed9Q99KF1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed9Q99KF1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed9Q99KF1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed9Q99KF1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed9Q99KF1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed9Q99KF1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed9Q99KF1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed9Q99KF1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed9Q99KF1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed9Q99KF1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms