Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Higd1bQ99JY6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Higd1bQ99JY6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Higd1bQ99JY6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Higd1bQ99JY6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Higd1bQ99JY6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Higd1bQ99JY6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Higd1bQ99JY6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Higd1bQ99JY6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Higd1bQ99JY6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Higd1bQ99JY6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Higd1bQ99JY6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Higd1bQ99JY6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Higd1bQ99JY6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Higd1bQ99JY6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Higd1bQ99JY6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Higd1bQ99JY6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Higd1bQ99JY6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Higd1bQ99JY6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Higd1bQ99JY6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Higd1bQ99JY6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Higd1bQ99JY6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Higd1bQ99JY6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Higd1bQ99JY6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Higd1bQ99JY6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Higd1bQ99JY6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Higd1bQ99JY6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Higd1bQ99JY6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Higd1bQ99JY6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Higd1bQ99JY6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Higd1bQ99JY6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Higd1bQ99JY6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Higd1bQ99JY6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Higd1bQ99JY6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Higd1bQ99JY6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Higd1bQ99JY6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Higd1bQ99JY6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Higd1bQ99JY6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Higd1bQ99JY6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Higd1bQ99JY6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Higd1bQ99JY6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Higd1bQ99JY6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Higd1bQ99JY6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Higd1bQ99JY6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Higd1bQ99JY6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Higd1bQ99JY6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Higd1bQ99JY6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Higd1bQ99JY6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Higd1bQ99JY6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Higd1bQ99JY6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Higd1bQ99JY6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Higd1bQ99JY6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Higd1bQ99JY6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Higd1bQ99JY6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Higd1bQ99JY6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Higd1bQ99JY6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Higd1bQ99JY6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Higd1bQ99JY6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Higd1bQ99JY6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Higd1bQ99JY6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Higd1bQ99JY6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Higd1bQ99JY6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Higd1bQ99JY6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Higd1bQ99JY6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Higd1bQ99JY6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Higd1bQ99JY6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Higd1bQ99JY6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Higd1bQ99JY6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Higd1bQ99JY6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Higd1bQ99JY6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Higd1bQ99JY6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Higd1bQ99JY6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Higd1bQ99JY6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Higd1bQ99JY6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Higd1bQ99JY6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Higd1bQ99JY6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Higd1bQ99JY6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Higd1bQ99JY6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Higd1bQ99JY6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Higd1bQ99JY6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Higd1bQ99JY6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Higd1bQ99JY6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Higd1bQ99JY6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Higd1bQ99JY6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Higd1bQ99JY6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Higd1bQ99JY6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Higd1bQ99JY6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Higd1bQ99JY6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Higd1bQ99JY6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Higd1bQ99JY6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Higd1bQ99JY6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Higd1bQ99JY6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Higd1bQ99JY6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Higd1bQ99JY6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Higd1bQ99JY6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Higd1bQ99JY6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Higd1bQ99JY6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Higd1bQ99JY6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Higd1bQ99JY6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Higd1bQ99JY6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms