Protein–RNA interactions for Protein: Q99J25

Mrm1, rRNA methyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrm1Q99J25 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mrm1Q99J25 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mrm1Q99J25 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mrm1Q99J25 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mrm1Q99J25 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mrm1Q99J25 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mrm1Q99J25 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mrm1Q99J25 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mrm1Q99J25 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mrm1Q99J25 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mrm1Q99J25 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mrm1Q99J25 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mrm1Q99J25 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mrm1Q99J25 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mrm1Q99J25 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mrm1Q99J25 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mrm1Q99J25 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mrm1Q99J25 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mrm1Q99J25 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mrm1Q99J25 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mrm1Q99J25 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mrm1Q99J25 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mrm1Q99J25 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mrm1Q99J25 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mrm1Q99J25 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mrm1Q99J25 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mrm1Q99J25 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mrm1Q99J25 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mrm1Q99J25 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mrm1Q99J25 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mrm1Q99J25 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mrm1Q99J25 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mrm1Q99J25 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mrm1Q99J25 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mrm1Q99J25 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mrm1Q99J25 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Mrm1Q99J25 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Mrm1Q99J25 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mrm1Q99J25 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mrm1Q99J25 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mrm1Q99J25 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mrm1Q99J25 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mrm1Q99J25 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mrm1Q99J25 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mrm1Q99J25 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mrm1Q99J25 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mrm1Q99J25 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mrm1Q99J25 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mrm1Q99J25 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mrm1Q99J25 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mrm1Q99J25 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mrm1Q99J25 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Mrm1Q99J25 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mrm1Q99J25 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mrm1Q99J25 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mrm1Q99J25 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mrm1Q99J25 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mrm1Q99J25 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mrm1Q99J25 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mrm1Q99J25 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrm1Q99J25 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrm1Q99J25 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrm1Q99J25 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrm1Q99J25 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mrm1Q99J25 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mrm1Q99J25 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mrm1Q99J25 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mrm1Q99J25 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrm1Q99J25 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrm1Q99J25 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mrm1Q99J25 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mrm1Q99J25 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mrm1Q99J25 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mrm1Q99J25 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mrm1Q99J25 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mrm1Q99J25 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mrm1Q99J25 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrm1Q99J25 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrm1Q99J25 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrm1Q99J25 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrm1Q99J25 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrm1Q99J25 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mrm1Q99J25 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mrm1Q99J25 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mrm1Q99J25 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mrm1Q99J25 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrm1Q99J25 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrm1Q99J25 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrm1Q99J25 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrm1Q99J25 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Mrm1Q99J25 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mrm1Q99J25 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mrm1Q99J25 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mrm1Q99J25 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mrm1Q99J25 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mrm1Q99J25 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mrm1Q99J25 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mrm1Q99J25 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mrm1Q99J25 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Mrm1Q99J25 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms