Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cts3Q91ZD5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cts3Q91ZD5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cts3Q91ZD5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cts3Q91ZD5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cts3Q91ZD5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cts3Q91ZD5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cts3Q91ZD5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cts3Q91ZD5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cts3Q91ZD5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cts3Q91ZD5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cts3Q91ZD5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cts3Q91ZD5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cts3Q91ZD5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cts3Q91ZD5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cts3Q91ZD5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cts3Q91ZD5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cts3Q91ZD5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cts3Q91ZD5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cts3Q91ZD5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cts3Q91ZD5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cts3Q91ZD5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cts3Q91ZD5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cts3Q91ZD5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cts3Q91ZD5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cts3Q91ZD5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cts3Q91ZD5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cts3Q91ZD5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cts3Q91ZD5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cts3Q91ZD5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cts3Q91ZD5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cts3Q91ZD5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cts3Q91ZD5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cts3Q91ZD5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cts3Q91ZD5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cts3Q91ZD5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cts3Q91ZD5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cts3Q91ZD5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cts3Q91ZD5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cts3Q91ZD5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cts3Q91ZD5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cts3Q91ZD5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cts3Q91ZD5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cts3Q91ZD5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cts3Q91ZD5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cts3Q91ZD5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cts3Q91ZD5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cts3Q91ZD5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cts3Q91ZD5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cts3Q91ZD5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cts3Q91ZD5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cts3Q91ZD5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cts3Q91ZD5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cts3Q91ZD5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cts3Q91ZD5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cts3Q91ZD5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cts3Q91ZD5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cts3Q91ZD5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cts3Q91ZD5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cts3Q91ZD5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cts3Q91ZD5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cts3Q91ZD5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cts3Q91ZD5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cts3Q91ZD5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cts3Q91ZD5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cts3Q91ZD5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cts3Q91ZD5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cts3Q91ZD5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cts3Q91ZD5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cts3Q91ZD5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cts3Q91ZD5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cts3Q91ZD5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cts3Q91ZD5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cts3Q91ZD5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cts3Q91ZD5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cts3Q91ZD5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cts3Q91ZD5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cts3Q91ZD5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cts3Q91ZD5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cts3Q91ZD5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cts3Q91ZD5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cts3Q91ZD5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cts3Q91ZD5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cts3Q91ZD5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cts3Q91ZD5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cts3Q91ZD5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cts3Q91ZD5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cts3Q91ZD5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cts3Q91ZD5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cts3Q91ZD5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cts3Q91ZD5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cts3Q91ZD5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cts3Q91ZD5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cts3Q91ZD5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cts3Q91ZD5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cts3Q91ZD5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cts3Q91ZD5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cts3Q91ZD5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cts3Q91ZD5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cts3Q91ZD5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms