Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC7

Nipal2, NIPA-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipal2Q91WC7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nipal2Q91WC7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nipal2Q91WC7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nipal2Q91WC7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nipal2Q91WC7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nipal2Q91WC7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nipal2Q91WC7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nipal2Q91WC7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nipal2Q91WC7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nipal2Q91WC7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nipal2Q91WC7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nipal2Q91WC7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nipal2Q91WC7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nipal2Q91WC7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nipal2Q91WC7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nipal2Q91WC7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nipal2Q91WC7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nipal2Q91WC7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nipal2Q91WC7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nipal2Q91WC7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nipal2Q91WC7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nipal2Q91WC7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nipal2Q91WC7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nipal2Q91WC7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nipal2Q91WC7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nipal2Q91WC7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nipal2Q91WC7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nipal2Q91WC7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nipal2Q91WC7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nipal2Q91WC7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nipal2Q91WC7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nipal2Q91WC7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nipal2Q91WC7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nipal2Q91WC7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nipal2Q91WC7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nipal2Q91WC7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nipal2Q91WC7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nipal2Q91WC7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nipal2Q91WC7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nipal2Q91WC7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nipal2Q91WC7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nipal2Q91WC7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nipal2Q91WC7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nipal2Q91WC7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nipal2Q91WC7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Nipal2Q91WC7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nipal2Q91WC7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nipal2Q91WC7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nipal2Q91WC7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nipal2Q91WC7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nipal2Q91WC7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Nipal2Q91WC7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nipal2Q91WC7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nipal2Q91WC7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nipal2Q91WC7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nipal2Q91WC7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nipal2Q91WC7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nipal2Q91WC7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nipal2Q91WC7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nipal2Q91WC7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nipal2Q91WC7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nipal2Q91WC7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nipal2Q91WC7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nipal2Q91WC7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nipal2Q91WC7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nipal2Q91WC7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nipal2Q91WC7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nipal2Q91WC7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nipal2Q91WC7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nipal2Q91WC7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nipal2Q91WC7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Nipal2Q91WC7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nipal2Q91WC7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nipal2Q91WC7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nipal2Q91WC7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Nipal2Q91WC7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nipal2Q91WC7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nipal2Q91WC7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nipal2Q91WC7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nipal2Q91WC7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nipal2Q91WC7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nipal2Q91WC7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nipal2Q91WC7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nipal2Q91WC7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nipal2Q91WC7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nipal2Q91WC7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nipal2Q91WC7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nipal2Q91WC7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nipal2Q91WC7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nipal2Q91WC7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nipal2Q91WC7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nipal2Q91WC7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nipal2Q91WC7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nipal2Q91WC7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nipal2Q91WC7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nipal2Q91WC7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nipal2Q91WC7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nipal2Q91WC7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nipal2Q91WC7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nipal2Q91WC7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms