Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp3Q91W36 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp3Q91W36 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp3Q91W36 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp3Q91W36 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp3Q91W36 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp3Q91W36 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp3Q91W36 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp3Q91W36 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp3Q91W36 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp3Q91W36 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp3Q91W36 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp3Q91W36 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp3Q91W36 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp3Q91W36 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp3Q91W36 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp3Q91W36 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp3Q91W36 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp3Q91W36 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp3Q91W36 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp3Q91W36 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp3Q91W36 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp3Q91W36 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp3Q91W36 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp3Q91W36 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp3Q91W36 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp3Q91W36 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Usp3Q91W36 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp3Q91W36 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp3Q91W36 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp3Q91W36 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp3Q91W36 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp3Q91W36 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp3Q91W36 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp3Q91W36 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp3Q91W36 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp3Q91W36 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp3Q91W36 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp3Q91W36 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp3Q91W36 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp3Q91W36 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp3Q91W36 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp3Q91W36 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp3Q91W36 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp3Q91W36 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp3Q91W36 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp3Q91W36 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp3Q91W36 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp3Q91W36 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp3Q91W36 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp3Q91W36 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp3Q91W36 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp3Q91W36 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp3Q91W36 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp3Q91W36 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp3Q91W36 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp3Q91W36 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp3Q91W36 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp3Q91W36 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp3Q91W36 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp3Q91W36 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp3Q91W36 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp3Q91W36 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp3Q91W36 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp3Q91W36 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp3Q91W36 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp3Q91W36 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp3Q91W36 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp3Q91W36 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp3Q91W36 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp3Q91W36 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp3Q91W36 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp3Q91W36 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp3Q91W36 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp3Q91W36 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp3Q91W36 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp3Q91W36 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp3Q91W36 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp3Q91W36 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp3Q91W36 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp3Q91W36 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp3Q91W36 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp3Q91W36 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Usp3Q91W36 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp3Q91W36 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp3Q91W36 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp3Q91W36 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp3Q91W36 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp3Q91W36 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp3Q91W36 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp3Q91W36 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp3Q91W36 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp3Q91W36 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp3Q91W36 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp3Q91W36 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp3Q91W36 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp3Q91W36 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp3Q91W36 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp3Q91W36 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp3Q91W36 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms