Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms