Protein–RNA interactions for Protein: Q91VN6

Ddx41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx41Q91VN6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ddx41Q91VN6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ddx41Q91VN6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ddx41Q91VN6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ddx41Q91VN6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ddx41Q91VN6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ddx41Q91VN6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ddx41Q91VN6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ddx41Q91VN6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ddx41Q91VN6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ddx41Q91VN6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ddx41Q91VN6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddx41Q91VN6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddx41Q91VN6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddx41Q91VN6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ddx41Q91VN6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ddx41Q91VN6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddx41Q91VN6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddx41Q91VN6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddx41Q91VN6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddx41Q91VN6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ddx41Q91VN6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ddx41Q91VN6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ddx41Q91VN6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ddx41Q91VN6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ddx41Q91VN6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ddx41Q91VN6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ddx41Q91VN6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ddx41Q91VN6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ddx41Q91VN6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ddx41Q91VN6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ddx41Q91VN6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ddx41Q91VN6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ddx41Q91VN6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ddx41Q91VN6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ddx41Q91VN6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddx41Q91VN6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ddx41Q91VN6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ddx41Q91VN6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ddx41Q91VN6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ddx41Q91VN6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ddx41Q91VN6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ddx41Q91VN6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ddx41Q91VN6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ddx41Q91VN6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ddx41Q91VN6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ddx41Q91VN6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ddx41Q91VN6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ddx41Q91VN6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ddx41Q91VN6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ddx41Q91VN6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ddx41Q91VN6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ddx41Q91VN6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ddx41Q91VN6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ddx41Q91VN6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ddx41Q91VN6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ddx41Q91VN6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddx41Q91VN6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddx41Q91VN6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddx41Q91VN6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ddx41Q91VN6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ddx41Q91VN6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ddx41Q91VN6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ddx41Q91VN6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
Ddx41Q91VN6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ddx41Q91VN6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ddx41Q91VN6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ddx41Q91VN6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ddx41Q91VN6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ddx41Q91VN6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ddx41Q91VN6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddx41Q91VN6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ddx41Q91VN6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddx41Q91VN6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddx41Q91VN6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddx41Q91VN6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddx41Q91VN6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx41Q91VN6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddx41Q91VN6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddx41Q91VN6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddx41Q91VN6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddx41Q91VN6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddx41Q91VN6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddx41Q91VN6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ddx41Q91VN6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ddx41Q91VN6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ddx41Q91VN6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ddx41Q91VN6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ddx41Q91VN6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ddx41Q91VN6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ddx41Q91VN6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ddx41Q91VN6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ddx41Q91VN6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ddx41Q91VN6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ddx41Q91VN6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ddx41Q91VN6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ddx41Q91VN6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ddx41Q91VN6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ddx41Q91VN6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ddx41Q91VN6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms