Protein–RNA interactions for Protein: Q91UZ8

Pcdhb11, MCG141285, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb11Q91UZ8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcdhb11Q91UZ8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcdhb11Q91UZ8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdhb11Q91UZ8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdhb11Q91UZ8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdhb11Q91UZ8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdhb11Q91UZ8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdhb11Q91UZ8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdhb11Q91UZ8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdhb11Q91UZ8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Pcdhb11Q91UZ8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdhb11Q91UZ8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdhb11Q91UZ8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdhb11Q91UZ8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdhb11Q91UZ8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdhb11Q91UZ8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdhb11Q91UZ8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdhb11Q91UZ8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdhb11Q91UZ8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcdhb11Q91UZ8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcdhb11Q91UZ8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdhb11Q91UZ8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdhb11Q91UZ8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdhb11Q91UZ8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcdhb11Q91UZ8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdhb11Q91UZ8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdhb11Q91UZ8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdhb11Q91UZ8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdhb11Q91UZ8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcdhb11Q91UZ8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcdhb11Q91UZ8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcdhb11Q91UZ8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcdhb11Q91UZ8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdhb11Q91UZ8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdhb11Q91UZ8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdhb11Q91UZ8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdhb11Q91UZ8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdhb11Q91UZ8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdhb11Q91UZ8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdhb11Q91UZ8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdhb11Q91UZ8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdhb11Q91UZ8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcdhb11Q91UZ8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcdhb11Q91UZ8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcdhb11Q91UZ8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcdhb11Q91UZ8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcdhb11Q91UZ8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdhb11Q91UZ8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdhb11Q91UZ8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdhb11Q91UZ8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pcdhb11Q91UZ8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdhb11Q91UZ8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdhb11Q91UZ8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdhb11Q91UZ8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdhb11Q91UZ8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdhb11Q91UZ8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdhb11Q91UZ8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdhb11Q91UZ8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdhb11Q91UZ8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdhb11Q91UZ8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdhb11Q91UZ8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdhb11Q91UZ8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdhb11Q91UZ8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdhb11Q91UZ8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcdhb11Q91UZ8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcdhb11Q91UZ8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdhb11Q91UZ8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcdhb11Q91UZ8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcdhb11Q91UZ8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcdhb11Q91UZ8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcdhb11Q91UZ8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcdhb11Q91UZ8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcdhb11Q91UZ8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcdhb11Q91UZ8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcdhb11Q91UZ8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcdhb11Q91UZ8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcdhb11Q91UZ8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdhb11Q91UZ8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdhb11Q91UZ8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdhb11Q91UZ8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcdhb11Q91UZ8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcdhb11Q91UZ8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcdhb11Q91UZ8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcdhb11Q91UZ8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdhb11Q91UZ8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcdhb11Q91UZ8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdhb11Q91UZ8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdhb11Q91UZ8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdhb11Q91UZ8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdhb11Q91UZ8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdhb11Q91UZ8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdhb11Q91UZ8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdhb11Q91UZ8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdhb11Q91UZ8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdhb11Q91UZ8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdhb11Q91UZ8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdhb11Q91UZ8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdhb11Q91UZ8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdhb11Q91UZ8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdhb11Q91UZ8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms