Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Stx18Q8VDS8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Stx18Q8VDS8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx18Q8VDS8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx18Q8VDS8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx18Q8VDS8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx18Q8VDS8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx18Q8VDS8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx18Q8VDS8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx18Q8VDS8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx18Q8VDS8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx18Q8VDS8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx18Q8VDS8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx18Q8VDS8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx18Q8VDS8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx18Q8VDS8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx18Q8VDS8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx18Q8VDS8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx18Q8VDS8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx18Q8VDS8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx18Q8VDS8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx18Q8VDS8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx18Q8VDS8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx18Q8VDS8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx18Q8VDS8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx18Q8VDS8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx18Q8VDS8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx18Q8VDS8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx18Q8VDS8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx18Q8VDS8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx18Q8VDS8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx18Q8VDS8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx18Q8VDS8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx18Q8VDS8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx18Q8VDS8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx18Q8VDS8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx18Q8VDS8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx18Q8VDS8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx18Q8VDS8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx18Q8VDS8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx18Q8VDS8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx18Q8VDS8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx18Q8VDS8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx18Q8VDS8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx18Q8VDS8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx18Q8VDS8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx18Q8VDS8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stx18Q8VDS8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stx18Q8VDS8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stx18Q8VDS8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stx18Q8VDS8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx18Q8VDS8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx18Q8VDS8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx18Q8VDS8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx18Q8VDS8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx18Q8VDS8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx18Q8VDS8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx18Q8VDS8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx18Q8VDS8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx18Q8VDS8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx18Q8VDS8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx18Q8VDS8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx18Q8VDS8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx18Q8VDS8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx18Q8VDS8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx18Q8VDS8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx18Q8VDS8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx18Q8VDS8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx18Q8VDS8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx18Q8VDS8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx18Q8VDS8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx18Q8VDS8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx18Q8VDS8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx18Q8VDS8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx18Q8VDS8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx18Q8VDS8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx18Q8VDS8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx18Q8VDS8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx18Q8VDS8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx18Q8VDS8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx18Q8VDS8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx18Q8VDS8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx18Q8VDS8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx18Q8VDS8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx18Q8VDS8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx18Q8VDS8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx18Q8VDS8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx18Q8VDS8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx18Q8VDS8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx18Q8VDS8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx18Q8VDS8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx18Q8VDS8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx18Q8VDS8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx18Q8VDS8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx18Q8VDS8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx18Q8VDS8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx18Q8VDS8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx18Q8VDS8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx18Q8VDS8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx18Q8VDS8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms